More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0590 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 294 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  71.23 
 
 		 300 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  65.61 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  64.91 
 
 		 294 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  64.56 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  36.59 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  35.54 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.04 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  34.74 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 338 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 1035 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 727 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 544 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  33.33 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 		 581 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  29.59 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 597 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 363 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  27.51 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 573 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 1177 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 1177 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.9 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 373 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 361 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.89 
 
 		 466 aa  99  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 304 aa  99  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.58 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.88 
 
 		 341 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  40.15 
 
 		 983 aa  98.6  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.45 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 374 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 		 358 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 386 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 380 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 336 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 		 455 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  33.52 
 
 		 235 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  28.14 
 
 		 355 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 384 aa  93.6  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 344 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 		 257 aa  93.2  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  27.98 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 		 266 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 373 aa  92.4  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.48 
 
 		 367 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.95 
 
 		 642 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.9 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 777 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.9 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>