72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1781 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  49.13 
 
 
173 aa  171  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  52.3 
 
 
176 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  52.07 
 
 
173 aa  166  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  43.27 
 
 
179 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  42.67 
 
 
180 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  38.95 
 
 
179 aa  111  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  31.39 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  34.56 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  36.84 
 
 
169 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  34.58 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  33.02 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  36.36 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  31.2 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  32.41 
 
 
219 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01345  hypothetical protein  29.41 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  32.77 
 
 
159 aa  51.6  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  28.28 
 
 
222 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  34.44 
 
 
160 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  30.85 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  32.43 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  28.71 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  39.51 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  24.38 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  36.49 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_002950  PG0253  hypothetical protein  31.39 
 
 
152 aa  48.9  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  26.28 
 
 
157 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  27.1 
 
 
157 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  26.67 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  27.22 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  25.58 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  29.03 
 
 
159 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0529  hypothetical protein  28.7 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  30.23 
 
 
162 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  24.51 
 
 
151 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  25.64 
 
 
151 aa  45.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  29.66 
 
 
175 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  29.82 
 
 
179 aa  44.7  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  27.38 
 
 
151 aa  44.7  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  24.79 
 
 
151 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  24.79 
 
 
151 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  25.96 
 
 
173 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  24.67 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  32.62 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  26.97 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  30.69 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  24.79 
 
 
151 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  22.76 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  26.92 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  26.92 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  25 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  27.1 
 
 
151 aa  43.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0595  hypothetical protein  27.78 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  28.74 
 
 
159 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  28.12 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  26.79 
 
 
151 aa  42  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  21.88 
 
 
172 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  27.18 
 
 
159 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  25.84 
 
 
154 aa  42  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  24.04 
 
 
158 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  28.95 
 
 
152 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1022  hypothetical protein  28.92 
 
 
183 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  25 
 
 
158 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  29.69 
 
 
161 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  26.97 
 
 
153 aa  41.2  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  31.33 
 
 
159 aa  41.2  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  25.27 
 
 
151 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  26.36 
 
 
196 aa  41.2  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>