85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1022 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1022  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18921  hypothetical protein  96.72 
 
 
183 aa  363  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16131  hypothetical protein  44.1 
 
 
171 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04161  hypothetical protein  45.64 
 
 
154 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.545305 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2078  hypothetical protein  41.5 
 
 
155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.353581  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0595  hypothetical protein  42.36 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16821  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16951  hypothetical protein  35.29 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.189399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1871  hypothetical protein  31.13 
 
 
153 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.017158  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3979  hypothetical protein  32.17 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0596  hypothetical protein  29.14 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16711  hypothetical protein  36.55 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2088  protein of unknown function DUF150  28.48 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1584  hypothetical protein  36.73 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2713  hypothetical protein  32.64 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3390  hypothetical protein  32.64 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2023  hypothetical protein  32.12 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2360  hypothetical protein  27.86 
 
 
155 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  24.64 
 
 
199 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  27.13 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  29.79 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  25.36 
 
 
153 aa  51.6  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  25.36 
 
 
150 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  27.12 
 
 
262 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  22.3 
 
 
154 aa  51.2  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  26.27 
 
 
259 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  21.58 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  29.81 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  39.33 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  27.37 
 
 
263 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  23.08 
 
 
181 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  27.62 
 
 
257 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  26.62 
 
 
154 aa  48.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  25.26 
 
 
260 aa  48.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  30.43 
 
 
161 aa  48.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  22.95 
 
 
272 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  26.95 
 
 
181 aa  47.8  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  23.66 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  21.92 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  21.48 
 
 
196 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  26.47 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  26.92 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  25.9 
 
 
225 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  30.77 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  27.78 
 
 
206 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  26.55 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  30.1 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0896  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000785256  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  25.53 
 
 
204 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  24.79 
 
 
259 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  24.04 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  24.67 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  24.51 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  21.53 
 
 
151 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  30.23 
 
 
253 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  27.07 
 
 
151 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  20.42 
 
 
152 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  22.76 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  25.53 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2319  protein of unknown function DUF150  31 
 
 
157 aa  44.7  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0432974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  24.16 
 
 
186 aa  44.7  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  24.58 
 
 
286 aa  44.3  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  26.73 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  27.84 
 
 
220 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  26.73 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  27.18 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0832  protein of unknown function DUF150  29.09 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000130104  hitchhiker  0.000000375903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  25.93 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 
279 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  20.98 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  21.23 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  27.74 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  22.9 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  18.84 
 
 
153 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  28.92 
 
 
191 aa  42  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  29.51 
 
 
159 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  25.25 
 
 
204 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  22.61 
 
 
175 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  24.65 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  25.5 
 
 
144 aa  41.2  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  29.63 
 
 
219 aa  41.2  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  29.63 
 
 
219 aa  41.2  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0997  protein of unknown function DUF150  24.03 
 
 
150 aa  40.8  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000846805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  27.5 
 
 
238 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39868  predicted protein  27.42 
 
 
248 aa  40.8  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>