298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0832 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0832  protein of unknown function DUF150  100 
 
 		 164 aa  333  7e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000130104  hitchhiker  0.000000375903 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  43.31 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  39.07 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09340  hypothetical protein  37.42 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000007629  normal  0.602574 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  39.26 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  38.4 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  37.04 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  36.6 
 
 		 176 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  37.23 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  39.13 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  31.13 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  33.8 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  30.07 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.56 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  34.71 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  30.07 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  36.28 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  33.83 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  35.56 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  38.81 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  35.43 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  29.41 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  36.28 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  32.35 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  35.4 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  35.4 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  35.4 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  35.4 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  35.4 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  35.4 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  35.4 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  30.5 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  35.29 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  34.78 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  40.83 
 
 		 203 aa  77.4  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  34.13 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  31.76 
 
 		 207 aa  77.4  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  31.82 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  35.48 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  33.12 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  31.82 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  31.17 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  31.17 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  34 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  31.17 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  30.07 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  32.82 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  31.17 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  31.17 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  37.7 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  33.58 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  32.82 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  30.41 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  31.17 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  32.84 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  31.17 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  31.17 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  39.67 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  36.61 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  27.7 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  38.98 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  31.17 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  38.98 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  30.52 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  30.52 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  30.52 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  31.01 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  40.35 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  36.64 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  34.23 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  32.61 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  28.29 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  30.08 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  30.06 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  30.06 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  34.17 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  33.09 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  33.09 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  33.08 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  30.52 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  33.09 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  29.22 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  35.54 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  30.06 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  32.79 
 
 		 286 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  34.51 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  30.89 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  30.89 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  30.89 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  30.89 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  32.41 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>