More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0896 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0896  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000785256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  41.91 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  45.11 
 
 
161 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  38.69 
 
 
153 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  42.55 
 
 
157 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  40.58 
 
 
158 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  40.69 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  40.71 
 
 
144 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  39.71 
 
 
153 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  41.55 
 
 
161 aa  94.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  40.91 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  38.78 
 
 
159 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  36.23 
 
 
176 aa  93.6  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  38.57 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  39.39 
 
 
154 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  37.86 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  37.86 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  37.86 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  37.86 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  37.86 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  37.86 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  37.86 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  43.48 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  37.86 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  39.46 
 
 
159 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  37.59 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  39.42 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  40.74 
 
 
157 aa  87.8  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0773  protein of unknown function DUF150  38.24 
 
 
164 aa  87.4  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  37.78 
 
 
154 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  35.71 
 
 
171 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  38.78 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  36.55 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  37.59 
 
 
150 aa  84.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  47.71 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  35 
 
 
171 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  34.31 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  36.88 
 
 
151 aa  83.6  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  38.57 
 
 
160 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0832  hypothetical protein  36.43 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0955131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  38.57 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  35.25 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  40.85 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  37.67 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  36.17 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  38.73 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2454  hypothetical protein  34.51 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00782404  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  29.71 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1325  hypothetical protein  35 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1351  hypothetical protein  35 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  40.71 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  31.21 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  30.89 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  32.85 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  30.89 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  36.97 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  34.97 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  31.91 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  35.29 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  31.21 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2319  protein of unknown function DUF150  31.88 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0432974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  37.19 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  36.64 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  34.11 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  35.54 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  35.88 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.25 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  35 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0810  hypothetical protein  32.12 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0615439  hitchhiker  0.00120973 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  31.21 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  32.62 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  34.4 
 
 
160 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1871  hypothetical protein  35.07 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.017158  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  33.59 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  31.21 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  36.36 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  32.59 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  31.06 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  31.06 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2030  hypothetical protein  35.71 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>