279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1731 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  306  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  98.03 
 
 
152 aa  303  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  98.03 
 
 
152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  92.11 
 
 
152 aa  286  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  91.5 
 
 
153 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  91.5 
 
 
153 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  91.5 
 
 
153 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  91.5 
 
 
153 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  91.45 
 
 
152 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  91.45 
 
 
152 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  91.5 
 
 
153 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  91.45 
 
 
152 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  91.5 
 
 
153 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  91.5 
 
 
153 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  90.85 
 
 
153 aa  283  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  90.79 
 
 
152 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  91.45 
 
 
152 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  91.45 
 
 
152 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2030  hypothetical protein  64.97 
 
 
162 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2033  hypothetical protein  64.33 
 
 
162 aa  208  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1208  hypothetical protein  59.24 
 
 
162 aa  191  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1115  hypothetical protein  59.87 
 
 
162 aa  191  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1287  hypothetical protein  58.6 
 
 
162 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00293096  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1923  hypothetical protein  53.42 
 
 
177 aa  160  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1699  hypothetical protein  50 
 
 
183 aa  158  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264433 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  52.05 
 
 
142 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1229  hypothetical protein  46.34 
 
 
163 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0921139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  48.28 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1095  hypothetical protein  46.01 
 
 
163 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2424  hypothetical protein  47.06 
 
 
200 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000350737  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2454  hypothetical protein  50.67 
 
 
146 aa  135  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00782404  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  50.71 
 
 
144 aa  135  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2013  hypothetical protein  44.16 
 
 
202 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000868215  normal  0.600676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  48.61 
 
 
144 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2746  hypothetical protein  42.05 
 
 
212 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3385  hypothetical protein  41.54 
 
 
202 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214146  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2132  hypothetical protein  41.45 
 
 
204 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  45.64 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  44.97 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2988  hypothetical protein  40.64 
 
 
192 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390443  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  45.64 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  44.97 
 
 
151 aa  117  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1245  hypothetical protein  42.33 
 
 
197 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2563  hypothetical protein  41.8 
 
 
219 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  hitchhiker  0.00397879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  43.24 
 
 
154 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  41.89 
 
 
191 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  41.22 
 
 
238 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  42.57 
 
 
150 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  42.57 
 
 
150 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  42.57 
 
 
150 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  42.57 
 
 
154 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  42.57 
 
 
154 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  41.89 
 
 
150 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  43.24 
 
 
150 aa  104  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  41.89 
 
 
150 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  41.89 
 
 
150 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  41.89 
 
 
150 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  41.89 
 
 
150 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  41.89 
 
 
150 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  41.89 
 
 
154 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  41.89 
 
 
154 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  40.54 
 
 
201 aa  103  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  40.82 
 
 
150 aa  103  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  40.94 
 
 
153 aa  103  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  41.67 
 
 
140 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  43.84 
 
 
176 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  39.86 
 
 
150 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  40.54 
 
 
150 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  40.54 
 
 
150 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  40.54 
 
 
150 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  41.33 
 
 
152 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  41.33 
 
 
152 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  40.28 
 
 
140 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  40.97 
 
 
140 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  44.83 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  40 
 
 
257 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  42.07 
 
 
161 aa  96.7  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  48.18 
 
 
153 aa  97.1  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  48.18 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  39.73 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  39.73 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  40 
 
 
169 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  39.33 
 
 
169 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  39.33 
 
 
169 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  42.28 
 
 
153 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  37.33 
 
 
251 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  37.09 
 
 
173 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  37.33 
 
 
251 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  41.89 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  40.27 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  39.86 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  36.67 
 
 
165 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  36.67 
 
 
255 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  44.2 
 
 
162 aa  90.5  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  38.41 
 
 
157 aa  90.1  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  37.59 
 
 
166 aa  90.1  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  36.36 
 
 
169 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>