245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2746 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2746  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3385  hypothetical protein  78.82 
 
 		 202 aa  302  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214146  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2988  hypothetical protein  79.59 
 
 		 192 aa  298  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1245  hypothetical protein  78.5 
 
 		 197 aa  295  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2132  hypothetical protein  74.88 
 
 		 204 aa  295  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2563  hypothetical protein  77.5 
 
 		 219 aa  291  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  hitchhiker  0.00397879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2013  hypothetical protein  69.85 
 
 		 202 aa  281  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000868215  normal  0.600676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2424  hypothetical protein  68.32 
 
 		 200 aa  267  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000350737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2751  hypothetical protein  61.16 
 
 		 295 aa  251  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891527  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1923  hypothetical protein  48.98 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1699  hypothetical protein  49.75 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  41.75 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  41.75 
 
 		 152 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  41.75 
 
 		 152 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  41.75 
 
 		 152 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  41.24 
 
 		 152 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2033  hypothetical protein  40.31 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1095  hypothetical protein  38.97 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  41.75 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  41.24 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  41.24 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  40.72 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  40.72 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  41.24 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  41.24 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  41.24 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  41.24 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  41.24 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1229  hypothetical protein  39.58 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0921139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  41.24 
 
 		 153 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2030  hypothetical protein  39.29 
 
 		 162 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  42.05 
 
 		 152 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  41.24 
 
 		 152 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1115  hypothetical protein  39.8 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1287  hypothetical protein  38.78 
 
 		 162 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00293096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1208  hypothetical protein  39.29 
 
 		 162 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  45.59 
 
 		 144 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  43.38 
 
 		 142 aa  92  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2454  hypothetical protein  38.16 
 
 		 146 aa  91.7  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  43.24 
 
 		 161 aa  91.3  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  35.46 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  36.13 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  35.51 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  31.52 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  37.78 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  35.19 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  35.11 
 
 		 159 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  34.29 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  33.82 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  37.01 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  29.69 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  34.81 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  34.81 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  34.85 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  35.22 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  35.95 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  36.3 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  41.67 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  34.09 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  36.8 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  34.09 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  34.09 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  36.09 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  35.34 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  34.84 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  34.84 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  36.03 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  32.62 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  36.67 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  29.84 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2516  hypothetical protein  35.92 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  34.62 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  32.86 
 
 		 154 aa  62  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  34.56 
 
 		 165 aa  62  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  34.75 
 
 		 176 aa  62  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  33.57 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  32.14 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  35.94 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  37.5 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  34.48 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  34.09 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  33.58 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  31.91 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  37.07 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  37.3 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  34.96 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1413  hypothetical protein  34.44 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000509228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  32.14 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  34.03 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  32.14 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  33.81 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>