248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2132 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2132  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3385  hypothetical protein  73.81 
 
 		 202 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214146  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2746  hypothetical protein  74.88 
 
 		 212 aa  295  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2988  hypothetical protein  75.76 
 
 		 192 aa  290  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1245  hypothetical protein  75.25 
 
 		 197 aa  289  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2563  hypothetical protein  74.75 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  hitchhiker  0.00397879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2013  hypothetical protein  67.48 
 
 		 202 aa  281  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000868215  normal  0.600676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2424  hypothetical protein  69.19 
 
 		 200 aa  259  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000350737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2751  hypothetical protein  57.37 
 
 		 295 aa  243  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891527  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1923  hypothetical protein  45.81 
 
 		 177 aa  154  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1699  hypothetical protein  45.85 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  43.01 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  43.01 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  43.01 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1115  hypothetical protein  41 
 
 		 162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  41.97 
 
 		 152 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1208  hypothetical protein  40.5 
 
 		 162 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  42.49 
 
 		 152 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1287  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00293096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2030  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  41.97 
 
 		 152 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  41.97 
 
 		 152 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1229  hypothetical protein  38.86 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0921139  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1095  hypothetical protein  37.82 
 
 		 163 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  41.97 
 
 		 152 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2033  hypothetical protein  37 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  40.41 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  40.41 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  40.41 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  40.41 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  40.41 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  40.41 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  40.41 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  40.41 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  41.45 
 
 		 152 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  41.45 
 
 		 152 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  44.96 
 
 		 144 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2454  hypothetical protein  41.09 
 
 		 146 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  49.09 
 
 		 142 aa  91.7  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  45.63 
 
 		 161 aa  89.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  33.53 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  38.78 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  36.62 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  36.42 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  36.43 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  36.42 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  32.35 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  36.72 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  31.43 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  34.76 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  40.18 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  36.15 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  34.09 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  35.2 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  35.07 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  37.21 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  33.83 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  34.07 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  35.45 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  36.72 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  37.21 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  37.4 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  36.72 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  33.1 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  32.85 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  34.65 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  30.87 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  35.16 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  33.86 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  40.38 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  36.89 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.838305 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  37.96 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  34.09 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  34.09 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  35.15 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  34.59 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  32.8 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  32.58 
 
 		 150 aa  62  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  37.6 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  32.86 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  34.55 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  32.81 
 
 		 259 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  34.55 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  40.59 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  50.85 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  39.22 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  34.09 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  32.74 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>