250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2013 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2013  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000868215  normal  0.600676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2424  hypothetical protein  86.27 
 
 		 200 aa  325  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000350737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2132  hypothetical protein  67.48 
 
 		 204 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2746  hypothetical protein  69.85 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2988  hypothetical protein  72.22 
 
 		 192 aa  280  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1245  hypothetical protein  70.71 
 
 		 197 aa  274  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3385  hypothetical protein  69.8 
 
 		 202 aa  272  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214146  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2563  hypothetical protein  70.2 
 
 		 219 aa  272  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  hitchhiker  0.00397879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2751  hypothetical protein  51.82 
 
 		 295 aa  223  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891527  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1923  hypothetical protein  48.73 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1699  hypothetical protein  47.94 
 
 		 183 aa  151  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  46.07 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  46.07 
 
 		 152 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  46.07 
 
 		 152 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  46.07 
 
 		 152 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  45.55 
 
 		 152 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  45.55 
 
 		 152 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1115  hypothetical protein  44.04 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  45.55 
 
 		 152 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1208  hypothetical protein  43.52 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1287  hypothetical protein  43.08 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00293096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  45.03 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  45.03 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2033  hypothetical protein  43.52 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  45.03 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  45.03 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  45.03 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  45.03 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  45.03 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  44.5 
 
 		 153 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  44.5 
 
 		 152 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  44.16 
 
 		 152 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2030  hypothetical protein  44.04 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  44.5 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1095  hypothetical protein  40.31 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1229  hypothetical protein  40.31 
 
 		 163 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0921139  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  47.66 
 
 		 144 aa  104  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2454  hypothetical protein  41.22 
 
 		 146 aa  98.2  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  47.71 
 
 		 142 aa  95.9  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  43.4 
 
 		 161 aa  88.2  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  40.74 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  37.59 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  38.76 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  39.69 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  37.68 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  31.58 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  46.36 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  38.66 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  35.71 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  41.35 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  40.52 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  42.31 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  46.46 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  34.75 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  39.37 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  39.26 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  38.35 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  36.29 
 
 		 286 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  38.35 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  34.62 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  35.92 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  33.52 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  35.46 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  37.59 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  35.46 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  35.46 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  35.46 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  37.59 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  35.46 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  35.46 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  35.46 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  35.46 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  38.31 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  35.46 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  35.46 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  34.93 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  35.46 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  35.77 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  35.46 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.77 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  37.96 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  35.46 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  38.39 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  33.73 
 
 		 152 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  34.65 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  35.16 
 
 		 140 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  35.21 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  33.73 
 
 		 152 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  34.69 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  33.53 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  33.53 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  35.04 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  38.39 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  42 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  35.77 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  40.38 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  40.38 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  34.13 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  35.61 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>