245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2023 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2023  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  306  9e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2360  hypothetical protein  56.58 
 
 
155 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1871  hypothetical protein  57.72 
 
 
153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.017158  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0596  hypothetical protein  55.92 
 
 
153 aa  174  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2088  protein of unknown function DUF150  55.92 
 
 
154 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2713  hypothetical protein  53.29 
 
 
153 aa  167  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3979  hypothetical protein  54.97 
 
 
172 aa  168  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3390  hypothetical protein  53.29 
 
 
153 aa  167  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2078  hypothetical protein  44 
 
 
155 aa  116  9e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.353581  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04161  hypothetical protein  39.33 
 
 
154 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.545305 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0595  hypothetical protein  40.29 
 
 
166 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16131  hypothetical protein  32.67 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16821  hypothetical protein  35.25 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  36.44 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16951  hypothetical protein  37.07 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.189399  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18921  hypothetical protein  29.14 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  30.99 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1022  hypothetical protein  32.12 
 
 
183 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  28.97 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  35.16 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  34.69 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  33.1 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  34.01 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  34.46 
 
 
186 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1584  hypothetical protein  35.04 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  29.05 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  31.16 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16711  hypothetical protein  36.21 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  33.09 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1413  hypothetical protein  31.07 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000509228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  31.65 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  30.95 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  30.07 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  30.72 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  30.28 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  29.58 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  29.58 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  26.35 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  29.58 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  31.76 
 
 
185 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0773  protein of unknown function DUF150  30.28 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  28.87 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  28.87 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  28.87 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  28.87 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  28.87 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  28.87 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  28.87 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  29.92 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  33.68 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  28.08 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  28.47 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  30.72 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  33.62 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  32.63 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  31.45 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  30.56 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  31.93 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  30.34 
 
 
171 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  30.34 
 
 
171 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  29.5 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  25.36 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  31.3 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2319  protein of unknown function DUF150  26.35 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0432974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  31.25 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  27.4 
 
 
199 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  40.7 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  25.36 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  29.37 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  40.7 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  27.78 
 
 
196 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0832  hypothetical protein  24.82 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0955131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  27.86 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0529  hypothetical protein  34.07 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  27.14 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  29.66 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  27.2 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  36.05 
 
 
259 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  31.54 
 
 
203 aa  53.9  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  27.4 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  31.29 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  28.7 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  33.66 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  33.72 
 
 
262 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  29.93 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0896  hypothetical protein  30.3 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000785256  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  28.93 
 
 
206 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  29.63 
 
 
209 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1325  hypothetical protein  26.28 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0606  protein of unknown function DUF150  39.47 
 
 
147 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000662285  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1351  hypothetical protein  26.28 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  30.4 
 
 
225 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  29.63 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  30.63 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  31.53 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  25 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  28.48 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  30 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>