45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0031 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  641    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  48.96 
 
 		 276 aa  96.3  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  41.23 
 
 		 281 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  43.24 
 
 		 480 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  38.94 
 
 		 545 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  45.19 
 
 		 535 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  49.44 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  46.99 
 
 		 505 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  38.93 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  42.11 
 
 		 470 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  42.05 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  46.58 
 
 		 533 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  38.66 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  37.67 
 
 		 990 aa  69.7  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  37.67 
 
 		 978 aa  69.7  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  39.39 
 
 		 966 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  37.65 
 
 		 993 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  33.77 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  39.76 
 
 		 1079 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  41.03 
 
 		 911 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  42.86 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  41.25 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  37.5 
 
 		 1108 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0352  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  37.14 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  22 
 
 		 835 aa  54.7  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  33.77 
 
 		 727 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0904  sporulation related  33.33 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1371  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  30.89 
 
 		 465 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0442  Sporulation domain protein  32.91 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  35.29 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  32.1 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  35.11 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  35.87 
 
 		 511 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  26.57 
 
 		 1888 aa  45.4  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2257  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.58 
 
 		 503 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.53676  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  29.11 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  33.58 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1699  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  30.81 
 
 		 587 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0899262  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4800  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.21 
 
 		 494 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5267  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.21 
 
 		 494 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  30.12 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  29.49 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  30.38 
 
 		 463 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3123  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 273 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.174152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5343  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.89 
 
 		 494 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>