More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0860 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
160 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  60.67 
 
 
150 aa  206  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  58.28 
 
 
157 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.09 
 
 
158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  55.13 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.21 
 
 
158 aa  189  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.78 
 
 
183 aa  177  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  47.47 
 
 
159 aa  175  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.47 
 
 
159 aa  175  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.69 
 
 
163 aa  174  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.75 
 
 
155 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.71 
 
 
155 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.04 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.91 
 
 
161 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
155 aa  160  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.59 
 
 
157 aa  158  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  46.36 
 
 
154 aa  158  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  46.75 
 
 
161 aa  156  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.84 
 
 
160 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.44 
 
 
157 aa  153  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  45.89 
 
 
164 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  49.68 
 
 
149 aa  152  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.72 
 
 
159 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.7 
 
 
161 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.41 
 
 
164 aa  146  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.41 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  43.24 
 
 
153 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.22 
 
 
211 aa  140  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.57 
 
 
190 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  49.29 
 
 
148 aa  137  6e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.52 
 
 
223 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.31 
 
 
214 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  36.22 
 
 
188 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.4 
 
 
158 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  44.59 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.48 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  40.91 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  38.1 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.95 
 
 
188 aa  127  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  44.44 
 
 
156 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  42.48 
 
 
158 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  37.67 
 
 
151 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.04 
 
 
163 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.52 
 
 
157 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.33 
 
 
158 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  39.47 
 
 
158 aa  120  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  39.74 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.83 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  38.41 
 
 
155 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  45.3 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  38 
 
 
154 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  38 
 
 
154 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.94 
 
 
301 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.97 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.1 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.75 
 
 
153 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.61 
 
 
161 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.24 
 
 
153 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.83 
 
 
156 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
163 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.76 
 
 
153 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.71 
 
 
153 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.26 
 
 
190 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.71 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.81 
 
 
158 aa  94  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.52 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.28 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.32 
 
 
190 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.24 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.13 
 
 
143 aa  91.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.19 
 
 
147 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  43 
 
 
168 aa  90.9  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.13 
 
 
148 aa  90.9  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  36.3 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2842  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  32 
 
 
194 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0449  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  47.37 
 
 
140 aa  89.7  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.02 
 
 
147 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  35.71 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.35 
 
 
166 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.76 
 
 
149 aa  87.4  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.3 
 
 
162 aa  87.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.58 
 
 
162 aa  87  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.71 
 
 
146 aa  87  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  36.84 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.24 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.17 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.59 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.02 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.09 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.13 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.65 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  36.75 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1655  guanine deaminase  33.77 
 
 
298 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.75 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.83 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0072  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.56 
 
 
204 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  43.68 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0911  cytidine and deoxycytidylate deaminase  37.72 
 
 
149 aa  84.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.312122  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  39 
 
 
182 aa  84.7  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>