164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2858 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  100 
 
 		 450 aa  897    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  59.65 
 
 		 453 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  54.81 
 
 		 458 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  54.46 
 
 		 458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  52.03 
 
 		 486 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  35.92 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  30.94 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  30.75 
 
 		 446 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  31.84 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  34.59 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  34.35 
 
 		 450 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  27.94 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  30.75 
 
 		 456 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  35.68 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  32.08 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  32.82 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  32 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  34.25 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  30.51 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  32.3 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  35.44 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  29.33 
 
 		 457 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  35.01 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  35.36 
 
 		 468 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  32.95 
 
 		 454 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  33.79 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  33.41 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  32.79 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  33.97 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  32.66 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  32.79 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  33.55 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  33.73 
 
 		 494 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  33.1 
 
 		 483 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  33.65 
 
 		 454 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  30.18 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  32.51 
 
 		 500 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  33.41 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  39.11 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  29.33 
 
 		 463 aa  150  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  31.28 
 
 		 456 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  29.62 
 
 		 449 aa  149  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  30.67 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  31.89 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  31.04 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  34.25 
 
 		 455 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  27.97 
 
 		 490 aa  146  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  29.65 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  31.67 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.22 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  29.17 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  34.34 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 		 481 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  26.73 
 
 		 481 aa  143  6e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  34.18 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  33.51 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  33.26 
 
 		 454 aa  141  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  29.05 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 		 464 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  31.24 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  31.05 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  32.81 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  31.21 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  33.64 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  32.17 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  27.77 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  30.93 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  30.12 
 
 		 458 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  33.04 
 
 		 454 aa  136  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  34.25 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  27.17 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  31.06 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  30.2 
 
 		 467 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  26.54 
 
 		 469 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  33.26 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  33.89 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  29.63 
 
 		 474 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  32.61 
 
 		 462 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  34.15 
 
 		 482 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  30.16 
 
 		 451 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  33.64 
 
 		 503 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  28.44 
 
 		 476 aa  126  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  28.24 
 
 		 449 aa  123  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  31.85 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  26.32 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  29.98 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  28.67 
 
 		 489 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  31.85 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  28.63 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  31.87 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  33.96 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  28.41 
 
 		 450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.56 
 
 		 465 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  35.6 
 
 		 443 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  28.54 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  27.27 
 
 		 504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  34.56 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  30.12 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  31.34 
 
 		 451 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>