More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2169 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  80.09 
 
 		 226 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  79.28 
 
 		 222 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  78.83 
 
 		 222 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2488  methyltransferase type 11  74.66 
 
 		 223 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  50.93 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  52.25 
 
 		 226 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  52.11 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  53.55 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  46.64 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  31.64 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  28.87 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.08 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  26.01 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  28.16 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  25 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  27.62 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  30.64 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  27.62 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  28.11 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.49 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  27.07 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  27.07 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  27.07 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  30.77 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  30.22 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  32.77 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  28.65 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  29.76 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.55 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  27.38 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  32.69 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.9 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  27.06 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  39.81 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.65 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  25 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  28.72 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  40.78 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  25 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  28.12 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  29.06 
 
 		 323 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  37.93 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.68 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.72 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 264 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 291 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.3 
 
 		 305 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 280 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.7 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  28.8 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  28.8 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  28.07 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.38 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.8 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  28.8 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  28.48 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.36 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  28.8 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>