More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2124 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  69.34 
 
 		 426 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  69.34 
 
 		 426 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  69.34 
 
 		 426 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 427 aa  880    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  69.81 
 
 		 426 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  69.34 
 
 		 426 aa  634    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  69.34 
 
 		 426 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  69.34 
 
 		 426 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  69.34 
 
 		 426 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  69.34 
 
 		 426 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  68.87 
 
 		 426 aa  631  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  64.61 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  63.9 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  63.66 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  63.66 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  63.9 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  63.66 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  63.9 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  62.23 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  64.05 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  64.86 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  60.85 
 
 		 440 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  61.08 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  61.08 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  62.5 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  60.85 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  60.85 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  60.38 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  61.56 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  61.56 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  61.79 
 
 		 428 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  61.32 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  60.38 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  60.38 
 
 		 428 aa  544  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  60.61 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  61.43 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  58.39 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  59.43 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  59.2 
 
 		 428 aa  531  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  58.67 
 
 		 433 aa  523  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 		 427 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  48.46 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  44.03 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  44.26 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  43.63 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  44.58 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  43.66 
 
 		 437 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  45.72 
 
 		 430 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 		 435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 		 435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  41.55 
 
 		 435 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  45.48 
 
 		 430 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  40.94 
 
 		 435 aa  353  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 		 434 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  41.23 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  41.92 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  42.59 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 435 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 435 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 		 431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  42.12 
 
 		 430 aa  339  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  41.88 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  40.56 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  41.41 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  41.41 
 
 		 430 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  41.41 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  40.89 
 
 		 430 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  40.89 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 435 aa  325  9e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  40.65 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 433 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 433 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  44.5 
 
 		 430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  44.25 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 		 429 aa  319  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 433 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 		 433 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  38.46 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  39.34 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  39.76 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>