More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0127 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  81.72 
 
 
458 aa  725  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  81.4 
 
 
457 aa  723  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  84.4 
 
 
456 aa  714  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  80.04 
 
 
457 aa  693  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  80.04 
 
 
457 aa  693  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  80.04 
 
 
457 aa  693  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  78.73 
 
 
457 aa  665  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  80.04 
 
 
457 aa  693  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  80.04 
 
 
457 aa  693  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  79.82 
 
 
457 aa  692  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  80.04 
 
 
457 aa  694  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  80.04 
 
 
457 aa  693  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.60495e-07 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  80.26 
 
 
457 aa  696  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  81.72 
 
 
458 aa  725  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  80.04 
 
 
457 aa  693  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  80.26 
 
 
457 aa  696  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  98.46 
 
 
456 aa  911  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  100 
 
 
456 aa  923  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  84.21 
 
 
456 aa  717  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  80.04 
 
 
457 aa  693  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  80.04 
 
 
457 aa  693  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  81.72 
 
 
458 aa  725  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  80.04 
 
 
457 aa  693  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  44.96 
 
 
462 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  44.98 
 
 
464 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  45.18 
 
 
468 aa  343  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  45.57 
 
 
464 aa  333  4e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.6955e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  43.41 
 
 
462 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  3.59419e-12 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  37.75 
 
 
453 aa  264  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
458 aa  254  2e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  36.87 
 
 
458 aa  252  8e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  1.37847e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
449 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
449 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
454 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
458 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  36.32 
 
 
449 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  2.6524e-09 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
466 aa  246  5e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  35.64 
 
 
458 aa  245  1e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  37.14 
 
 
449 aa  239  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  39.63 
 
 
471 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
455 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  4.04182e-09 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
455 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
459 aa  229  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.34801e-06  unclonable  3.36351e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
449 aa  223  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
389 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  30.8 
 
 
472 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
467 aa  185  1e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
459 aa  181  3e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.58656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  35.21 
 
 
453 aa  181  3e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  29.96 
 
 
455 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  36.7 
 
 
452 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  30.04 
 
 
455 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  38.72 
 
 
412 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  33.51 
 
 
465 aa  166  1e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
449 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  38.49 
 
 
449 aa  164  4e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  37.99 
 
 
465 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
469 aa  163  8e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
429 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  38.13 
 
 
449 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
454 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
469 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
421 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
445 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
442 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  37.5 
 
 
480 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  33.33 
 
 
461 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
461 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
420 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
419 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
435 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  9.971e-12 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0937  sensor histidine kinase  29.54 
 
 
440 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.47175e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  37.54 
 
 
429 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
458 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  30.93 
 
 
416 aa  153  6e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  35.23 
 
 
381 aa  153  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
455 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  35.74 
 
 
456 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  33.54 
 
 
433 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
440 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  33.54 
 
 
433 aa  150  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
456 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  34.94 
 
 
442 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  33.23 
 
 
433 aa  150  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  33.23 
 
 
433 aa  149  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  37.01 
 
 
468 aa  149  1e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
456 aa  149  1e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  30.67 
 
 
386 aa  148  2e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  33.23 
 
 
433 aa  148  2e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  34.07 
 
 
442 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  34.07 
 
 
442 aa  147  4e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  34.07 
 
 
442 aa  147  4e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  34.07 
 
 
442 aa  147  4e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  34.07 
 
 
442 aa  147  4e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  34.07 
 
 
442 aa  147  4e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
457 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
453 aa  146  7e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  32.17 
 
 
428 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  30.14 
 
 
451 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  32.92 
 
 
433 aa  144  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>