76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5118 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  883    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  51.95 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  51.49 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  48.42 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  44.54 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  39.95 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  40.45 
 
 		 442 aa  299  6e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  39.07 
 
 		 474 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  37.67 
 
 		 462 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.73 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  37.42 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  36.67 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.18 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  37.53 
 
 		 468 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  34.51 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.15 
 
 		 443 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.81 
 
 		 460 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.81 
 
 		 460 aa  203  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  33.77 
 
 		 473 aa  203  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  34.71 
 
 		 471 aa  203  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  34.34 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  35.65 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  37 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  32.54 
 
 		 467 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  32.91 
 
 		 467 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34 
 
 		 455 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  34.06 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.51 
 
 		 883 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.63 
 
 		 481 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.59 
 
 		 482 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  31.51 
 
 		 470 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  32.17 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  30.7 
 
 		 456 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  31.72 
 
 		 466 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  31.72 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  31.72 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  31.72 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  31.72 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  31.72 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  31.41 
 
 		 454 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  29.21 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  29.17 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 523 aa  156  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  27.39 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  29.19 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1751 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  26.34 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  27.87 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  28.7 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.29 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  26.45 
 
 		 490 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 479 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  25.05 
 
 		 507 aa  83.2  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  42.22 
 
 		 125 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  21.1 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  19.36 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  19.36 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2673  hypothetical protein  32.1 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  39.77 
 
 		 239 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  24.21 
 
 		 534 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  30.39 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  25 
 
 		 633 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  24.6 
 
 		 534 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  24.6 
 
 		 534 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 		 534 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.52 
 
 		 608 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5301  hypothetical protein  36.21 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.730903  normal  0.0168693 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  23.6 
 
 		 534 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  23.6 
 
 		 534 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  26.46 
 
 		 673 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.75 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>