123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2401 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  100 
 
 		 371 aa  756    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  60.82 
 
 		 382 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  33.46 
 
 		 286 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  31.3 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  31.3 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  29.17 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  29.1 
 
 		 274 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  29.1 
 
 		 274 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  29.1 
 
 		 274 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  31.82 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  29.37 
 
 		 274 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  30.43 
 
 		 274 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  30.58 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  28.73 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  28.73 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  30.17 
 
 		 276 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  30.17 
 
 		 276 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  30.17 
 
 		 276 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  30.17 
 
 		 276 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  30.17 
 
 		 276 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  30.17 
 
 		 276 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  30.17 
 
 		 276 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  30.17 
 
 		 276 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  28.81 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  28.51 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  29.75 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  28.51 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  27.91 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  28.51 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  27.91 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  28.1 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  29.37 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  29.37 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  29.37 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  29.37 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  29.37 
 
 		 274 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  28.97 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  28.97 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  29.05 
 
 		 274 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  29.05 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  31.54 
 
 		 241 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  30.08 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  30.08 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  30.08 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  29.6 
 
 		 243 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  29.6 
 
 		 243 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  29.6 
 
 		 243 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  29.63 
 
 		 243 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  28.8 
 
 		 243 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  28.8 
 
 		 243 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  27.57 
 
 		 243 aa  89.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  27.16 
 
 		 243 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  27.16 
 
 		 243 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  27.16 
 
 		 243 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  27.16 
 
 		 243 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  27.16 
 
 		 243 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  27.16 
 
 		 243 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  27.16 
 
 		 243 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  25.38 
 
 		 464 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  25.38 
 
 		 464 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  25.38 
 
 		 464 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  23.26 
 
 		 463 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  28.4 
 
 		 243 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  27.82 
 
 		 239 aa  86.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  27.82 
 
 		 239 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  27.53 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  24.08 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  27.43 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  25.85 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  25.97 
 
 		 504 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  24.62 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  24.29 
 
 		 241 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  24.62 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  24.62 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  24.29 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  24.54 
 
 		 246 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  24.1 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  25 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  23.14 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  23.69 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  21.61 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  28.08 
 
 		 213 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  26.28 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  26.7 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  22.99 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  26.58 
 
 		 210 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  24.18 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  26.03 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  24.89 
 
 		 213 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4189  OmpW family protein  24.1 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.570233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  24.43 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  26.71 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  25.32 
 
 		 210 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  23.63 
 
 		 210 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  23.46 
 
 		 224 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  28.77 
 
 		 210 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  25.43 
 
 		 218 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>