132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0772 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 470 aa  947    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  56.65 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  55.3 
 
 		 495 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  55.25 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  52.59 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  52.26 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  37.15 
 
 		 467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  34.99 
 
 		 472 aa  249  7e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  36.31 
 
 		 469 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  29.11 
 
 		 473 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  33.05 
 
 		 509 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  33.11 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  33.54 
 
 		 490 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  29.52 
 
 		 473 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  29.81 
 
 		 479 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  28.63 
 
 		 473 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  29.31 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  29.31 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  29.31 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  28.96 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  28.69 
 
 		 473 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  28.69 
 
 		 473 aa  223  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  34.07 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  32.64 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  28.54 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  30.09 
 
 		 474 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  28.97 
 
 		 456 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  29.38 
 
 		 482 aa  203  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  32.53 
 
 		 459 aa  200  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  33.56 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  33.56 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  29.39 
 
 		 442 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  31.97 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  28.23 
 
 		 441 aa  189  7e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  26.17 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  29.89 
 
 		 475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  31.44 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  29.5 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  33.83 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.61 
 
 		 465 aa  177  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  25.27 
 
 		 466 aa  177  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  25.27 
 
 		 466 aa  177  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  23.85 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  30.82 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  22.64 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  22.5 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  22.64 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  22.64 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  22.64 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  22.43 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  23.54 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  23.54 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  22.43 
 
 		 463 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  23.11 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  28.7 
 
 		 488 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  26.39 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  29.05 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  27.72 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  27.73 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  28.22 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  26.24 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  28.31 
 
 		 463 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  30.46 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  29.61 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  28.83 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  30.37 
 
 		 423 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  29.51 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  27.51 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  25.51 
 
 		 488 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  25.28 
 
 		 477 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  28.3 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  27.41 
 
 		 482 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  29.4 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  27.3 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  25.49 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  28.27 
 
 		 482 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  25.05 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  27.21 
 
 		 454 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  27.41 
 
 		 460 aa  97.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  24.5 
 
 		 553 aa  94.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  27.55 
 
 		 589 aa  94.4  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  27.25 
 
 		 493 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  26.5 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  27.39 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  27.39 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  27.81 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  26.19 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  26.38 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  28.48 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  25.81 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  23.57 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  26.26 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  22.94 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  23.34 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  22.48 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  25.92 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  25.28 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  24.79 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>