208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3418 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 735 aa  1519    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  56.49 
 
 		 750 aa  890    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  39.1 
 
 		 766 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  38.16 
 
 		 771 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  37.13 
 
 		 773 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  37.39 
 
 		 764 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  38.11 
 
 		 766 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  37.6 
 
 		 773 aa  531  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  37.69 
 
 		 774 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  37.73 
 
 		 765 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  37.97 
 
 		 765 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  37.34 
 
 		 765 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  37.34 
 
 		 765 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  37.25 
 
 		 765 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  37.25 
 
 		 765 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  35.93 
 
 		 774 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  38.2 
 
 		 765 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  35.64 
 
 		 765 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  37.78 
 
 		 765 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  34.25 
 
 		 787 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  33.38 
 
 		 780 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  33.38 
 
 		 750 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  33.11 
 
 		 750 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  32.52 
 
 		 799 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  31.31 
 
 		 799 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  32.16 
 
 		 781 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  32.45 
 
 		 784 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  32.45 
 
 		 784 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  31.9 
 
 		 801 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  32.45 
 
 		 784 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  32.45 
 
 		 784 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  31.37 
 
 		 790 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  32.45 
 
 		 784 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  32.45 
 
 		 784 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0060  organic solvent tolerance protein  32.31 
 
 		 773 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00055163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  31.71 
 
 		 785 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  32.31 
 
 		 784 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  30.85 
 
 		 781 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  32.03 
 
 		 784 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  32.08 
 
 		 786 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  32.08 
 
 		 786 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  32.08 
 
 		 786 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  32.08 
 
 		 786 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  30.12 
 
 		 781 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  31.7 
 
 		 781 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  31.99 
 
 		 807 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  31.39 
 
 		 787 aa  372  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  32.41 
 
 		 738 aa  362  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  29.71 
 
 		 784 aa  361  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  31.67 
 
 		 757 aa  344  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  30.27 
 
 		 938 aa  343  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  30.34 
 
 		 922 aa  343  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  30.75 
 
 		 919 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  30.37 
 
 		 924 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  30.96 
 
 		 753 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  29.18 
 
 		 926 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.84 
 
 		 905 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  30.07 
 
 		 813 aa  321  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  27.98 
 
 		 937 aa  320  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  30.41 
 
 		 836 aa  316  8e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  30.42 
 
 		 792 aa  316  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  30.42 
 
 		 792 aa  314  4.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  28.94 
 
 		 932 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  28.53 
 
 		 934 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  28.07 
 
 		 935 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  31.08 
 
 		 728 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  28.65 
 
 		 1091 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  27.14 
 
 		 826 aa  304  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  29.67 
 
 		 751 aa  303  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  32.15 
 
 		 849 aa  300  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 		 791 aa  286  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  26.83 
 
 		 839 aa  286  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  27.66 
 
 		 860 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  26.7 
 
 		 839 aa  284  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  30.1 
 
 		 803 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  29.87 
 
 		 794 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  29.5 
 
 		 783 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  29.21 
 
 		 794 aa  274  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  27.44 
 
 		 786 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  28.16 
 
 		 787 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  28.16 
 
 		 787 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  27.21 
 
 		 786 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  29.76 
 
 		 820 aa  273  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  28.16 
 
 		 787 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  28.16 
 
 		 787 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  28.16 
 
 		 787 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  28.16 
 
 		 787 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  28.16 
 
 		 761 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  27.49 
 
 		 786 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  27.49 
 
 		 786 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  27.44 
 
 		 786 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  27.49 
 
 		 786 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  27.41 
 
 		 787 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  27.08 
 
 		 788 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  26.78 
 
 		 786 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  26.87 
 
 		 929 aa  265  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  26.89 
 
 		 810 aa  263  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  27.35 
 
 		 811 aa  263  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  25.82 
 
 		 778 aa  263  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  26.52 
 
 		 821 aa  261  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>