33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1886 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  85.79 
 
 		 403 aa  681    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  84.79 
 
 		 405 aa  686    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  100 
 
 		 405 aa  800    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  82.22 
 
 		 407 aa  655    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  54.67 
 
 		 452 aa  468  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  47.7 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  49.37 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  48.51 
 
 		 413 aa  362  7.0000000000000005e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  45.71 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  41.61 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  54.68 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  38.28 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  45.31 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  50.37 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  48.89 
 
 		 517 aa  277  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  38.26 
 
 		 417 aa  276  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  51.3 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  39.09 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  51.32 
 
 		 439 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  37.85 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  40.57 
 
 		 408 aa  263  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  46.25 
 
 		 440 aa  254  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  33.69 
 
 		 477 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  47.53 
 
 		 461 aa  250  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  46.92 
 
 		 505 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  44.83 
 
 		 537 aa  240  4e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  43.89 
 
 		 491 aa  239  5e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  32.83 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  30.09 
 
 		 588 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  26.61 
 
 		 656 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  22.09 
 
 		 579 aa  43.5  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  40.32 
 
 		 662 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  32.22 
 
 		 842 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>