262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02748 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  100 
 
 
462 aa  919    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  56.85 
 
 
467 aa  525  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.72 
 
 
475 aa  333  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  39.44 
 
 
476 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  40.09 
 
 
443 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.09 
 
 
463 aa  325  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.11 
 
 
465 aa  323  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  36.74 
 
 
461 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.1 
 
 
465 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  49.68 
 
 
538 aa  307  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  40.58 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  40.58 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  40.58 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  40.58 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  39.38 
 
 
460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  39.38 
 
 
460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  39.38 
 
 
460 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  39.38 
 
 
460 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.07 
 
 
442 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  39.38 
 
 
460 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  39.38 
 
 
479 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  39.16 
 
 
460 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  39.38 
 
 
479 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  37.41 
 
 
442 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  39.16 
 
 
479 aa  300  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  37.22 
 
 
471 aa  299  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.41 
 
 
441 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.36 
 
 
472 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.18 
 
 
441 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  36.53 
 
 
442 aa  297  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.18 
 
 
441 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  39.69 
 
 
464 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  37.39 
 
 
477 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  36.53 
 
 
443 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.62 
 
 
442 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.56 
 
 
465 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.56 
 
 
466 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  36.46 
 
 
478 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  36.78 
 
 
478 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.93 
 
 
442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.54 
 
 
497 aa  281  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  35.11 
 
 
468 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  35.11 
 
 
468 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  35.11 
 
 
468 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  35.11 
 
 
468 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03868  transport protein  35.15 
 
 
514 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  33.71 
 
 
459 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  34.89 
 
 
468 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.56 
 
 
460 aa  276  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.89 
 
 
448 aa  273  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.75 
 
 
444 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.51 
 
 
477 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3707  sugar:cation symporter family protein  35.59 
 
 
511 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3869  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.25 
 
 
486 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  32.71 
 
 
442 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.99 
 
 
444 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.99 
 
 
444 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.99 
 
 
444 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.76 
 
 
444 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.54 
 
 
444 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1391  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.84 
 
 
461 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1026  ribosomal protein L9  32.68 
 
 
522 aa  250  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.814155  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.51 
 
 
457 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.89 
 
 
481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.33 
 
 
481 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.11 
 
 
481 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.04 
 
 
471 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  31.45 
 
 
447 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.14 
 
 
468 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.92 
 
 
471 aa  223  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  33.19 
 
 
466 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  33.19 
 
 
466 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  33.19 
 
 
466 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  32.98 
 
 
466 aa  216  9e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  29.5 
 
 
465 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  29.65 
 
 
457 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.64 
 
 
454 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  28.41 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0046  xylose-proton symporter  29.63 
 
 
471 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00152296  normal  0.141953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0047  xylose-proton symporter  29.63 
 
 
471 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0047  xylose-proton symporter  30.09 
 
 
457 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000774004  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0046  xylose-proton symporter  30.09 
 
 
457 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.26 
 
 
447 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4249  inner membrane symporter YihP  30 
 
 
460 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4294  inner membrane symporter YihP  30 
 
 
460 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3275  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  40.43 
 
 
513 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  29.79 
 
 
460 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  28.37 
 
 
437 aa  176  7e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.38 
 
 
475 aa  176  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  28.87 
 
 
468 aa  176  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.94 
 
 
461 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  28.94 
 
 
461 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  28.87 
 
 
468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  28.94 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  28.87 
 
 
468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  27.47 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  25.89 
 
 
462 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  32.07 
 
 
479 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  28.07 
 
 
467 aa  169  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.93 
 
 
480 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>