More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01708 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  100 
 
 
304 aa  600  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  74.65 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  68.44 
 
 
300 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  68.44 
 
 
300 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  55.64 
 
 
301 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  55.64 
 
 
301 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  55.64 
 
 
301 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  55.64 
 
 
301 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  54.44 
 
 
312 aa  295  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  54.12 
 
 
299 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  55.35 
 
 
316 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  55.35 
 
 
316 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  54.32 
 
 
299 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  55.03 
 
 
319 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  52.94 
 
 
297 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  52.96 
 
 
299 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  52.17 
 
 
297 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  46.24 
 
 
305 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  51.81 
 
 
297 aa  255  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  48.54 
 
 
313 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  48.39 
 
 
305 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 
305 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 
305 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  44.32 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  45.71 
 
 
306 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  52.99 
 
 
299 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  43.11 
 
 
302 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  44.17 
 
 
305 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  41.7 
 
 
299 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  41.42 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  41.6 
 
 
299 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  43.05 
 
 
309 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  41.97 
 
 
298 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  42.16 
 
 
299 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  41.98 
 
 
299 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  41.98 
 
 
299 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  41.6 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  40.67 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.6 
 
 
299 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.22 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  45.99 
 
 
304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  44.77 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 
304 aa  212  7.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  40.66 
 
 
326 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  47.57 
 
 
307 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  41.95 
 
 
308 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  44.83 
 
 
300 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  43.64 
 
 
308 aa  208  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  38.97 
 
 
315 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 
342 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  43.38 
 
 
327 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  49.26 
 
 
307 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 
305 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  39.06 
 
 
325 aa  202  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  39.39 
 
 
331 aa  201  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  39.11 
 
 
316 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  43.59 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  43.64 
 
 
309 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  42.59 
 
 
314 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  39.53 
 
 
340 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  37.23 
 
 
311 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  42.75 
 
 
325 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  42.75 
 
 
325 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  42.45 
 
 
313 aa  199  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  40.82 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  40.15 
 
 
315 aa  198  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  34.32 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  38.32 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  46.3 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.31 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  38.31 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  39.02 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  39.02 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  39.57 
 
 
334 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  35.53 
 
 
298 aa  196  6e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  43.49 
 
 
306 aa  196  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  39.02 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  40.27 
 
 
312 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 
303 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  40.27 
 
 
312 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  40.27 
 
 
312 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 
310 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  38.81 
 
 
307 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  40.27 
 
 
312 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  43.49 
 
 
305 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  35.48 
 
 
314 aa  193  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  39.93 
 
 
312 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  32.84 
 
 
306 aa  192  7e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  44.36 
 
 
356 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  43.53 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  38.35 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  43.53 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  43.53 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 
398 aa  189  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 
313 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  43.17 
 
 
313 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  43.17 
 
 
313 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  43.17 
 
 
313 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 
323 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>