More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5336 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  98.45 
 
 		 186 aa  255  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  97.67 
 
 		 201 aa  253  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  97.67 
 
 		 201 aa  253  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  90.7 
 
 		 186 aa  231  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  89.06 
 
 		 186 aa  227  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  87.5 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  88.28 
 
 		 186 aa  223  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  88.28 
 
 		 186 aa  223  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  88.28 
 
 		 186 aa  223  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  85.94 
 
 		 186 aa  219  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  85.94 
 
 		 186 aa  219  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  82.95 
 
 		 186 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  82.95 
 
 		 186 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  81.25 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  81.25 
 
 		 185 aa  211  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  81.25 
 
 		 185 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  81.25 
 
 		 185 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  81.25 
 
 		 185 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  81.25 
 
 		 185 aa  211  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  81.25 
 
 		 205 aa  210  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  80.95 
 
 		 188 aa  204  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  78.57 
 
 		 188 aa  200  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  71.88 
 
 		 188 aa  193  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  74.02 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  73.81 
 
 		 183 aa  187  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  68.5 
 
 		 184 aa  185  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  72.22 
 
 		 235 aa  185  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  71.43 
 
 		 192 aa  181  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  65.08 
 
 		 191 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  67.42 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  58.27 
 
 		 188 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  67.48 
 
 		 184 aa  150  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  62.6 
 
 		 187 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  52.31 
 
 		 192 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  50 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  57.26 
 
 		 188 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  56.45 
 
 		 188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  47.06 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  45.74 
 
 		 207 aa  110  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0986  resolvase-like protein  51.19 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  42.62 
 
 		 183 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  43.9 
 
 		 193 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  41.86 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 		 188 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 		 188 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.4 
 
 		 192 aa  87  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  37.6 
 
 		 313 aa  87.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  37.01 
 
 		 199 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  37.01 
 
 		 199 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  37.01 
 
 		 199 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  41.27 
 
 		 191 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.06 
 
 		 182 aa  84.3  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  42.06 
 
 		 191 aa  83.6  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.01 
 
 		 188 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  37.8 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  38.21 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  41.46 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  38.21 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  40.94 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  41.46 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  35.2 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  37.6 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  40.31 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  38.4 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  39.84 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  38.21 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  38.21 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  38.21 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  38.4 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  38.21 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  38.21 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  38.4 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  38.21 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  38.21 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.46 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  39.84 
 
 		 198 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.1 
 
 		 198 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  40.31 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  39.36 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  38.89 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  36.8 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  37.61 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  38.21 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  38.21 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  36.51 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  38.21 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  39.32 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  39.84 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.59 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  36 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  35.43 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  39.02 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  39.02 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  36.72 
 
 		 196 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  35.66 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  34.88 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  34.11 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  37.6 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>