More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3868 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  73.89 
 
 
747 aa  1018    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  55.79 
 
 
714 aa  796    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  62.84 
 
 
745 aa  873    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  57.47 
 
 
758 aa  814    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  73.62 
 
 
748 aa  1018    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  77.94 
 
 
737 aa  1040    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  55.81 
 
 
785 aa  794    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  58.78 
 
 
746 aa  814    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  74.45 
 
 
758 aa  1023    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 
719 aa  664    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  57.94 
 
 
747 aa  815    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  72.57 
 
 
754 aa  1006    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  74.15 
 
 
739 aa  1028    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  55.95 
 
 
741 aa  795    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  100 
 
 
748 aa  1486    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  57.51 
 
 
738 aa  808    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  73.99 
 
 
743 aa  1050    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  63.81 
 
 
767 aa  909    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  57.7 
 
 
744 aa  794    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  58.14 
 
 
741 aa  822    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  57.31 
 
 
734 aa  783    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  73.79 
 
 
747 aa  1031    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  56.01 
 
 
754 aa  815    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  58.85 
 
 
760 aa  838    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  57.85 
 
 
762 aa  815    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  56.42 
 
 
746 aa  810    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  54.52 
 
 
734 aa  747    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  57.72 
 
 
736 aa  808    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  57.38 
 
 
747 aa  825    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  57.54 
 
 
751 aa  842    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  90.7 
 
 
753 aa  1200    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  57.38 
 
 
733 aa  804    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  57.29 
 
 
733 aa  805    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  57.09 
 
 
762 aa  812    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  58.52 
 
 
744 aa  800    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  58.69 
 
 
723 aa  838    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  57.43 
 
 
759 aa  803    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  61.67 
 
 
709 aa  866    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  60 
 
 
691 aa  764    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  52.17 
 
 
739 aa  672    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  56.57 
 
 
715 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  52.85 
 
 
650 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  51.09 
 
 
614 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
687 aa  427  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  57.07 
 
 
552 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  57.07 
 
 
552 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
697 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  42.2 
 
 
774 aa  381  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  41.76 
 
 
639 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  45 
 
 
770 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  42.72 
 
 
785 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 
701 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  43.17 
 
 
783 aa  382  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  47.38 
 
 
696 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  33.42 
 
 
801 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  41.38 
 
 
769 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  43.82 
 
 
770 aa  379  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
681 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  41.94 
 
 
769 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  41.73 
 
 
769 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  48.56 
 
 
606 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  46.75 
 
 
601 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
724 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  40.22 
 
 
610 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  47.26 
 
 
604 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  45.66 
 
 
603 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 
598 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  43.33 
 
 
803 aa  365  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  41.38 
 
 
770 aa  365  2e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  39.28 
 
 
652 aa  364  3e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  32.37 
 
 
720 aa  360  8e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
728 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 
607 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 
691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
724 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  33.83 
 
 
704 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.97 
 
 
677 aa  355  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 
695 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 
673 aa  350  5e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  34.42 
 
 
715 aa  346  8e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
671 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  46.72 
 
 
701 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 
674 aa  341  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  32.04 
 
 
887 aa  342  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  34.26 
 
 
758 aa  342  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
919 aa  340  7e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  34.48 
 
 
783 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
673 aa  338  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 
728 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 
666 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
660 aa  337  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
702 aa  336  9e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.16 
 
 
784 aa  336  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  34.13 
 
 
736 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 
635 aa  335  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 
679 aa  335  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 
671 aa  335  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  44.3 
 
 
692 aa  334  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 
729 aa  334  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
919 aa  334  4e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>