287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2050 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  308  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  94 
 
 
150 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  67.41 
 
 
147 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  67.97 
 
 
147 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  64.93 
 
 
143 aa  188  3e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  61.15 
 
 
143 aa  181  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  63.43 
 
 
143 aa  176  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  57.46 
 
 
203 aa  169  8e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  55.88 
 
 
145 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  55.88 
 
 
145 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  54.61 
 
 
145 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  58.59 
 
 
181 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  54.61 
 
 
145 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  56.62 
 
 
145 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  54.61 
 
 
145 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  58.59 
 
 
181 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  58.59 
 
 
149 aa  166  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  58.59 
 
 
149 aa  166  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  58.59 
 
 
149 aa  166  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  58.59 
 
 
149 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  59.29 
 
 
153 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  57.86 
 
 
153 aa  162  2e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 
153 aa  162  2e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 
147 aa  160  4e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 
153 aa  160  5e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  56.62 
 
 
145 aa  160  5e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  54.48 
 
 
175 aa  159  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  3.75293e-05  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  55.4 
 
 
147 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  56.49 
 
 
160 aa  158  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  54.93 
 
 
149 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 
163 aa  158  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  55.4 
 
 
147 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 
164 aa  157  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  2.26869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 
142 aa  156  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  52.52 
 
 
188 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 
143 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 
148 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
149 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 
144 aa  154  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  56.82 
 
 
137 aa  151  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 
162 aa  151  3e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  7.5245e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  53.73 
 
 
150 aa  151  3e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
145 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 
162 aa  150  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  56.06 
 
 
153 aa  147  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 
147 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  7.91205e-06  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
155 aa  145  1e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 
150 aa  146  1e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  51.15 
 
 
145 aa  143  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  57.52 
 
 
125 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  50.74 
 
 
155 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.53197e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 
137 aa  140  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  50 
 
 
136 aa  140  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  46.27 
 
 
148 aa  139  2e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 
156 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  47.33 
 
 
138 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 
142 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  48.09 
 
 
142 aa  134  6e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  47.76 
 
 
150 aa  129  2e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  42.14 
 
 
146 aa  126  1e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  41.84 
 
 
146 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  45.93 
 
 
143 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  45.53 
 
 
147 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  45.53 
 
 
147 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  45.53 
 
 
147 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 
146 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  45.93 
 
 
143 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  44.03 
 
 
151 aa  120  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
146 aa  117  4e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 
149 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  36.42 
 
 
169 aa  103  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  37.32 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
161 aa  80.1  1e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
135 aa  72.4  2e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
139 aa  71.2  4e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  26.02 
 
 
156 aa  70.5  8e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  32.31 
 
 
161 aa  70.1  9e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
139 aa  70.1  1e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
136 aa  69.3  2e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.23 
 
 
134 aa  69.3  2e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  29.14 
 
 
154 aa  68.2  3e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
156 aa  67.4  6e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 
140 aa  67.4  7e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  28.97 
 
 
154 aa  67  8e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
140 aa  64.7  4e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
161 aa  64.7  4e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
157 aa  64.3  5e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
151 aa  63.9  8e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
146 aa  63.5  8e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
148 aa  63.2  1e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
149 aa  63.2  1e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  1.87556e-06  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
139 aa  62.4  2e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
162 aa  62.4  2e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
139 aa  62.8  2e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
149 aa  62  3e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
134 aa  61.6  4e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  6.86795e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
163 aa  61.2  4e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
156 aa  61.2  5e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
136 aa  60.8  6e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
145 aa  60.5  7e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>