263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0767 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_08191  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  87.64 
 
 
720 aa  1264    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0767  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
720 aa  1434    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00745719  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08211  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  86.81 
 
 
720 aa  1253    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.938458  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08241  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  69.54 
 
 
719 aa  1004    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10041  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  43.33 
 
 
720 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215358  normal  0.629602 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0163  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.09 
 
 
720 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07951  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  44.54 
 
 
720 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16721  glycyl-tRNA synthetase beta subunit  40.08 
 
 
721 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1241  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.54 
 
 
720 aa  538  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.232901  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1228  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.77 
 
 
723 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.315931 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.14 
 
 
711 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.14 
 
 
711 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0018  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.67 
 
 
728 aa  455  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.606807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.74 
 
 
719 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0794  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.81 
 
 
716 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934108  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2984  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.71 
 
 
733 aa  419  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4816  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.67 
 
 
717 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.642859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4587  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.53 
 
 
731 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.29 
 
 
687 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.67 
 
 
687 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.35 
 
 
686 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.16 
 
 
687 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.78 
 
 
694 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1208  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.38 
 
 
693 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0414092  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.6 
 
 
686 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.52 
 
 
687 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.93 
 
 
687 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.34 
 
 
688 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.29 
 
 
692 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.42 
 
 
688 aa  355  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  30.17 
 
 
695 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.95 
 
 
698 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0012  glycine--tRNA ligase  30.75 
 
 
690 aa  352  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.948293  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  30.88 
 
 
688 aa  352  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.05 
 
 
690 aa  350  6e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.87 
 
 
692 aa  347  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  28.55 
 
 
696 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1441  glycine--tRNA ligase  30.1 
 
 
700 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.764176  normal  0.147312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.99 
 
 
688 aa  342  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0038  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.82 
 
 
693 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.903555  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.36 
 
 
691 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.9 
 
 
694 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0993  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.97 
 
 
693 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2210  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.87 
 
 
694 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.237877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  32.04 
 
 
688 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2581  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.87 
 
 
694 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.595681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 
689 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.85 
 
 
690 aa  335  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 
689 aa  333  9e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.29 
 
 
689 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.29 
 
 
689 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.29 
 
 
689 aa  332  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.29 
 
 
689 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.2 
 
 
689 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.92 
 
 
690 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.29 
 
 
689 aa  332  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  30.29 
 
 
689 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.29 
 
 
689 aa  332  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3881  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.29 
 
 
689 aa  332  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.11 
 
 
689 aa  331  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.99 
 
 
689 aa  330  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.99 
 
 
689 aa  330  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.95 
 
 
688 aa  330  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.99 
 
 
689 aa  330  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0043  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.26 
 
 
694 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.54 
 
 
689 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.29 
 
 
688 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.78 
 
 
691 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3849  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.83 
 
 
689 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4037  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.83 
 
 
689 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.414013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3931  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.83 
 
 
689 aa  327  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3977  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.83 
 
 
689 aa  327  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.6 
 
 
689 aa  327  7e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31 
 
 
680 aa  327  7e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3868  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.81 
 
 
689 aa  327  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0163  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 
689 aa  324  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0335  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.7 
 
 
687 aa  324  4e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.74 
 
 
689 aa  323  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.11 
 
 
689 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0479  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.21 
 
 
688 aa  321  3e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1197  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.82 
 
 
673 aa  320  6e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0025  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.44 
 
 
689 aa  320  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0144037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.96 
 
 
705 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1195  glycine--tRNA ligase, beta subunit  29.85 
 
 
729 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.24 
 
 
694 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2965  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.09 
 
 
688 aa  318  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.425514  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2050  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.72 
 
 
693 aa  317  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  28.23 
 
 
691 aa  317  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.61 
 
 
696 aa  316  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  32.42 
 
 
679 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1092  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.24 
 
 
689 aa  312  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2499  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  29.44 
 
 
688 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0207  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.08 
 
 
692 aa  311  4e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.99 
 
 
684 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1248  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.79 
 
 
664 aa  310  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.295288  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  28.22 
 
 
693 aa  310  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.72 
 
 
689 aa  309  9e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1686  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.86 
 
 
696 aa  310  9e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78284  normal  0.0276337 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2116  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.07 
 
 
689 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.29 
 
 
683 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>