More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0106 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_01171  Fe-S oxidoreductase  92.73 
 
 
454 aa  870  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.72418  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0106  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  961  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01181  Fe-S oxidoreductase  92.95 
 
 
454 aa  869  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.681569  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01141  Fe-S oxidoreductase  82.82 
 
 
454 aa  790  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  60.27 
 
 
466 aa  577  1e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2337  hypothetical protein  59.73 
 
 
458 aa  573  1e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.587976  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02161  Fe-S oxidoreductase  58.78 
 
 
472 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01161  Fe-S oxidoreductase  59.24 
 
 
462 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2512  hypothetical protein  57.47 
 
 
452 aa  551  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0443  MiaB family RNA modification protein  57.67 
 
 
440 aa  542  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0377  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  56.91 
 
 
450 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0470  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  56.75 
 
 
438 aa  539  1e-152  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3733  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  58.76 
 
 
441 aa  541  1e-152  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0641  hypothetical protein  56.06 
 
 
440 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  56.88 
 
 
449 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4276  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  56.65 
 
 
449 aa  517  1e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0618  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.93 
 
 
448 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  7.54849e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0632  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.41 
 
 
448 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.30586e-35 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.82 
 
 
436 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.25 
 
 
450 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.16014e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3205  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.76 
 
 
447 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3199  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.58 
 
 
449 aa  363  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0716  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.25 
 
 
448 aa  361  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.99844e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1926  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.99 
 
 
444 aa  358  1e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3124  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.45 
 
 
442 aa  357  2e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.336e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2498  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.67 
 
 
486 aa  356  4e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3110  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.32 
 
 
446 aa  356  6e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.43108e-05  normal  0.954122 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.4 
 
 
440 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.98883e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.15 
 
 
453 aa  353  3e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.62674e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3205  hypothetical protein  40.85 
 
 
445 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.3464e-13  hitchhiker  3.00152e-20 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1074  hypothetical protein  43.46 
 
 
432 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0093  hypothetical protein  41.26 
 
 
483 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0100  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.48 
 
 
469 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0256489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0111  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.26 
 
 
469 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.48 
 
 
470 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2144  hypothetical protein  38.38 
 
 
504 aa  343  3e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0983  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.66 
 
 
440 aa  343  3e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.30864e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0034  2-methylthioadenine synthetase  39.33 
 
 
455 aa  342  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0678  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.22 
 
 
446 aa  342  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.58003e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1671  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.33 
 
 
487 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.813765  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1467  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.67 
 
 
444 aa  339  7e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.369998  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11970  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.25 
 
 
442 aa  336  6e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.0077e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0839  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.04 
 
 
450 aa  332  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1262  2-methylthioadenine synthetase  38.78 
 
 
439 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.467346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1929  putative tRNA modifying protein  42.25 
 
 
445 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1647  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.02 
 
 
445 aa  328  1e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5359  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.94 
 
 
437 aa  327  4e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.01 
 
 
430 aa  325  8e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  1.36513e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3605  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.69 
 
 
436 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.757621 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.32 
 
 
430 aa  323  4e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0735  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.59 
 
 
463 aa  322  9e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0865  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.82 
 
 
440 aa  322  1e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0318613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0531  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.79 
 
 
472 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680198  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1025  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.12 
 
 
433 aa  316  5e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.813856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1284  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.23 
 
 
482 aa  315  1e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.323089 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.85 
 
 
435 aa  314  2e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2402  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.53 
 
 
467 aa  313  3e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4495  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.67 
 
 
469 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  5.07978e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.36 
 
 
436 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1606  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.9 
 
 
456 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3525  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.89 
 
 
444 aa  308  1e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1803  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.43 
 
 
524 aa  308  1e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.6995  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1585  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.47 
 
 
444 aa  306  4e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678841  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1288  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.69 
 
 
431 aa  306  6e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13538  putative Fe-S oxidoreductase  36.5 
 
 
435 aa  304  2e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0653  2-methylthioadenine synthetase  35.38 
 
 
437 aa  303  3e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.835098  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2303  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.2 
 
 
467 aa  303  4e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.941264  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1944  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.42 
 
 
437 aa  303  6e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.99 
 
 
435 aa  303  6e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.038543 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0982  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.64 
 
 
441 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0675  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.84 
 
 
430 aa  301  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00122823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0953  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.42 
 
 
441 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0920  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.42 
 
 
441 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0894  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.42 
 
 
441 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.917524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1003  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.42 
 
 
441 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.902435  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1464  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.57 
 
 
440 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2510  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.42 
 
 
441 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105116  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3231  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.17 
 
 
440 aa  299  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.12995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1673  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.98 
 
 
442 aa  299  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00819  hypothetical protein  39.2 
 
 
441 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2197  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.39 
 
 
470 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0862  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.2 
 
 
441 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.746353  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2807  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.2 
 
 
441 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0906  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.2 
 
 
441 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0895  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.2 
 
 
441 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.465773  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00802  predicted SAM-dependent methyltransferase  39.2 
 
 
441 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0988  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.2 
 
 
441 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.479636  normal  0.703934 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2807  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.2 
 
 
441 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.63 
 
 
437 aa  296  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0588845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0146  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.05 
 
 
438 aa  295  8e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00677283  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1834  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.81 
 
 
473 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044841  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.77 
 
 
427 aa  295  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3331  hypothetical protein  38.22 
 
 
479 aa  292  9e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1582  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.67 
 
 
453 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.386337  normal  0.0216178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0770  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.09 
 
 
457 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.579434 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3568  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.36 
 
 
471 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1636  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.44 
 
 
453 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.413832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1911  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.67 
 
 
453 aa  290  5e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0408943 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6297  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.31 
 
 
453 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1782  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.31 
 
 
453 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>