More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1942 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  100 
 
 
436 aa  868    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0839  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  53.32 
 
 
450 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3110  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  48.64 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000143108  normal  0.954122 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11970  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.35 
 
 
442 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000060077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  45.85 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  45.41 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000298883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0983  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  44.55 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000730864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1926  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  45.93 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3199  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  47.51 
 
 
449 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3205  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  48.08 
 
 
447 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0716  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  47.96 
 
 
448 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000599844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0632  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  47.06 
 
 
448 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.3058599999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  44.27 
 
 
453 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000162674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3205  hypothetical protein  46.86 
 
 
445 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000023464  hitchhiker  3.0015199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0618  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  45.93 
 
 
448 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000754849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  45.82 
 
 
450 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000316014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0678  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.59 
 
 
446 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000258003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1929  putative tRNA modifying protein  43.88 
 
 
445 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1647  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  43.88 
 
 
445 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3124  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.95 
 
 
442 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000009336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1074  hypothetical protein  45.52 
 
 
432 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0111  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  47.25 
 
 
469 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0100  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  47.02 
 
 
469 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0256489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0034  2-methylthioadenine synthetase  44.7 
 
 
455 aa  361  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0093  hypothetical protein  47.48 
 
 
483 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1467  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  43.12 
 
 
444 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.369998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  46.79 
 
 
470 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2498  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  46.07 
 
 
486 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1585  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  46.35 
 
 
444 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678841  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1262  2-methylthioadenine synthetase  41.1 
 
 
439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.467346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1464  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.05 
 
 
440 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2144  hypothetical protein  40 
 
 
504 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2512  hypothetical protein  43.35 
 
 
452 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02161  Fe-S oxidoreductase  44.47 
 
 
472 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0641  hypothetical protein  41.72 
 
 
440 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0256  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.18 
 
 
430 aa  340  4e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13538  putative Fe-S oxidoreductase  40.6 
 
 
435 aa  339  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01141  Fe-S oxidoreductase  41.63 
 
 
454 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0470  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.46 
 
 
438 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  43.54 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0443  MiaB family RNA modification protein  42.69 
 
 
440 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0377  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.33 
 
 
450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0146  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  43.27 
 
 
438 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00677283  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01181  Fe-S oxidoreductase  40.72 
 
 
454 aa  335  9e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.681569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01171  Fe-S oxidoreductase  40.5 
 
 
454 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.72418  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.32 
 
 
430 aa  333  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2337  hypothetical protein  43.41 
 
 
458 aa  333  5e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.587976  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01161  Fe-S oxidoreductase  41.95 
 
 
462 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3231  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  44.55 
 
 
440 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.12995  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1405  hypothetical protein  43.18 
 
 
440 aa  331  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1757  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.88 
 
 
431 aa  329  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0106  hypothetical protein  40.36 
 
 
471 aa  329  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3733  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.97 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1025  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.69 
 
 
433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.813856  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26767  predicted protein  40.81 
 
 
450 aa  326  5e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.071035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3525  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.87 
 
 
444 aa  325  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.73 
 
 
430 aa  325  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0531  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.72 
 
 
472 aa  323  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680198  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.9 
 
 
449 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4276  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.9 
 
 
449 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.5 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.038543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1671  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.95 
 
 
487 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.813765  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41 
 
 
437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0588845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1592  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.08 
 
 
429 aa  319  5e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000486202  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.64 
 
 
435 aa  319  6e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0675  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.81 
 
 
430 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00122823  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0653  2-methylthioadenine synthetase  37.5 
 
 
437 aa  318  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.835098  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1623  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.48 
 
 
452 aa  318  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0963  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.09 
 
 
442 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3568  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.87 
 
 
471 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1760  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.28 
 
 
432 aa  316  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2283  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.82 
 
 
442 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5359  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.81 
 
 
437 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1513  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.42 
 
 
433 aa  310  4e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.627818  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2965  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.4 
 
 
441 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000711639  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0735  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.69 
 
 
463 aa  308  9e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1606  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.43 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132217 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0865  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.88 
 
 
440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0318613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1284  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.32 
 
 
482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.323089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3605  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.36 
 
 
436 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.757621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4495  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.2 
 
 
469 aa  305  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000507978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1063  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.46 
 
 
458 aa  302  8.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.270511  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0713  hypothetical protein  39.86 
 
 
438 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07500  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG, TIGR01125  38.71 
 
 
477 aa  301  1e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0247514  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0150  hypothetical protein  38.24 
 
 
434 aa  301  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0770  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.81 
 
 
457 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.579434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3120  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.48 
 
 
443 aa  300  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.41 
 
 
427 aa  300  5e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0234  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.76 
 
 
430 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00117133  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1834  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.5 
 
 
473 aa  299  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37650  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.26 
 
 
440 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1944  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.86 
 
 
437 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4016  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.22 
 
 
443 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  hitchhiker  0.00937866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2510  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.82 
 
 
441 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105116  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2197  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.34 
 
 
470 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0988  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.82 
 
 
441 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.479636  normal  0.703934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0894  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.09 
 
 
441 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.917524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0906  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.82 
 
 
441 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00819  hypothetical protein  39.82 
 
 
441 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0862  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.82 
 
 
441 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.746353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>