293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8024 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_8024  predicted protein  100 
 
 
112 aa  228  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0575  50S ribosomal protein L22  39.39 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  38.38 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0991  50S ribosomal protein L22  36.63 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560396  normal  0.0271545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1845  50S ribosomal protein L22  35.64 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000645692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1961  50S ribosomal protein L22  32.38 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0119726  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1228  50S ribosomal protein L22  33.66 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1435  50S ribosomal protein L22  33.66 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0550714  normal  0.0358127 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0671  50S ribosomal protein L22  38.38 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000218971  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0703  50S ribosomal protein L22  38.38 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000047619  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1673  50S ribosomal protein L22  36.73 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1337  50S ribosomal protein L22  33.66 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2683  50S ribosomal protein L22  36.63 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1550  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5065  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1369  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137344  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1191  50S ribosomal protein L22  32.67 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.355223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  36.63 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2741  ribosomal protein L22  34.34 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0607325  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1619  50S ribosomal protein L22  35.64 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362093  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  37.11 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0590  50S ribosomal protein L22  37.37 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  30 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2971  50S ribosomal protein L22  34 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1348  50S ribosomal protein L22  35.35 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2300  50S ribosomal protein L22  35.35 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3443  50S ribosomal protein L22  35.35 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3179  50S ribosomal protein L22  35.35 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3662  50S ribosomal protein L22  35.35 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  35.09 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  31.96 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  30 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  32.32 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0254  50S ribosomal protein L22  35.35 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0287  50S ribosomal protein L22  35.35 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2128  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.570722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2223  50S ribosomal protein L22  31.31 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  35.35 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  34.02 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0366  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1721  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0463489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1254  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0671662  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2813  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.569118  normal  0.433995 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  35.35 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2529  50S ribosomal protein L22  34.69 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  35.35 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1913  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2167  50S ribosomal protein L22  32.32 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2445  50S ribosomal protein L22  32.32 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  30.93 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0348  50S ribosomal protein L22  32.32 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0271  ribosomal protein L22  33 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  30.39 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  30.39 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  30.39 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  32.67 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0764  50S ribosomal protein L22  34.65 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.047416  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8608  predicted protein  35.79 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  32.65 
 
 
158 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  30 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  30 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  30 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  30 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  30 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  30 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  31.58 
 
 
109 aa  53.9  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1941  50S ribosomal protein L22  28.85 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  30 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  30 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  30 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  30 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  29.59 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0607  50S ribosomal protein L22  28.72 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  29.25 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  29 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0403  ribosomal protein L22  28 
 
 
218 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3174  50S ribosomal protein L22  31.96 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00426002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  26 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  32.32 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  34.34 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  32 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>