88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0126 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  100 
 
 		 411 aa  848    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  44.07 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  38.25 
 
 		 400 aa  289  8e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  36.51 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  37.03 
 
 		 417 aa  255  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  39.69 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  33.5 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  31.88 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  32.36 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  33.25 
 
 		 424 aa  215  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  31.33 
 
 		 428 aa  206  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04783  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  34.48 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  31.33 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  31.11 
 
 		 713 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  29.19 
 
 		 709 aa  160  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  29.8 
 
 		 540 aa  155  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.83 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.4 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3820  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.16 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.25 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.14 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  27.22 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.54 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.92 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.46 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.6 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.66 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.4 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.18 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.18 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.53 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  20.64 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  20.18 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.18 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  26.07 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.4 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.18 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.37 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.79 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0776  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.51 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.18 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3574  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.57 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.75 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  26.64 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.44 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  20 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.67 
 
 		 558 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.06 
 
 		 321 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  20.83 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  25.1 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.36 
 
 		 499 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3337  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.52 
 
 		 468 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912336 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  38.24 
 
 		 287 aa  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  25.2 
 
 		 471 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  25.2 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  33.82 
 
 		 569 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.65 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  25.2 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.38 
 
 		 519 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.55 
 
 		 499 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2730  putative phosphodiesterase-nucleotide pyrophosphatase  38.1 
 
 		 744 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204405  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3282  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.78 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.405873  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.65 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.78 
 
 		 307 aa  47.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.81 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.31 
 
 		 478 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2289  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.67 
 
 		 456 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0787093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.77 
 
 		 489 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4910  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.83 
 
 		 682 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  23.24 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  25.49 
 
 		 412 aa  46.6  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.1 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.74 
 
 		 684 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  21.92 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.33 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  23.55 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  23.24 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  23.24 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4307  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.95 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  40 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0937  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.74 
 
 		 610 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114509  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1377  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.15 
 
 		 562 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  25.97 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.9 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  0.0911762 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0220  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.25 
 
 		 533 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000131562  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.26 
 
 		 434 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  26.32 
 
 		 556 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.71 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>