140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5035 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  100 
 
 
367 aa  711    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  77.2 
 
 
365 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  76.92 
 
 
365 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  74.11 
 
 
363 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  76.18 
 
 
364 aa  511  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  70.35 
 
 
372 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  55.71 
 
 
358 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  58.56 
 
 
363 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  55.69 
 
 
356 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  56.82 
 
 
354 aa  355  8.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  50.14 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  47.19 
 
 
354 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  50.14 
 
 
348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  50.14 
 
 
348 aa  298  9e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  43.24 
 
 
416 aa  288  1e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  46.75 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  41.99 
 
 
370 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  41.73 
 
 
434 aa  272  8.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  46.09 
 
 
360 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  46.28 
 
 
354 aa  269  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  45.15 
 
 
351 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.94 
 
 
350 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  43.77 
 
 
354 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.63 
 
 
358 aa  263  4e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  43.77 
 
 
354 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  43.77 
 
 
354 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  43.77 
 
 
354 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  41.83 
 
 
348 aa  262  6e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  43.77 
 
 
351 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  43.49 
 
 
354 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.68 
 
 
349 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  43.49 
 
 
351 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  43.49 
 
 
351 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  40.56 
 
 
544 aa  259  7e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  43.49 
 
 
351 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  45.38 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.06 
 
 
350 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.06 
 
 
351 aa  253  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  43.49 
 
 
351 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  40.72 
 
 
367 aa  249  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  48.04 
 
 
356 aa  248  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  42.82 
 
 
374 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  40.71 
 
 
381 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  40.83 
 
 
361 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  39.4 
 
 
403 aa  224  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.42 
 
 
364 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  40.64 
 
 
331 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  39.46 
 
 
388 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  30.58 
 
 
324 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  38.29 
 
 
689 aa  145  8.000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  47.62 
 
 
599 aa  139  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  44.85 
 
 
742 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  29.33 
 
 
481 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  33.97 
 
 
365 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228892 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  23.79 
 
 
967 aa  109  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  41.9 
 
 
189 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  25.54 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  27.32 
 
 
1344 aa  85.9  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  26.14 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  28.11 
 
 
1129 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  25.27 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  25.66 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  26.86 
 
 
365 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  25.1 
 
 
362 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  26.81 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  23.05 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  26.4 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  26.4 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  23.44 
 
 
365 aa  57.4  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  26.62 
 
 
362 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  22.87 
 
 
365 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  25.19 
 
 
365 aa  56.2  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  26 
 
 
362 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  25.18 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  25.65 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  27.89 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  25.65 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  23.6 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  22.66 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  22.48 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  24.1 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  22.48 
 
 
361 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  23.6 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  23.6 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  24.1 
 
 
385 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  22.18 
 
 
325 aa  52.8  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  23.59 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  23.59 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  23.59 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  25.41 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  25.48 
 
 
368 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  25 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  25 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  25 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  25 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  34.74 
 
 
374 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  25.91 
 
 
377 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  23.98 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  23.57 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  24.62 
 
 
361 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>