More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3465 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  85.06 
 
 		 87 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  85.06 
 
 		 87 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  77.53 
 
 		 92 aa  146  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  83.33 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 95 aa  144  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  80.72 
 
 		 93 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 88 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  74.42 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  67.03 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 85 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 85 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 95 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 		 95 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 		 98 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 100 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 100 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 85 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 84 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  71.74 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  65.93 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 92 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  121  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  120  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  120  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  120  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 88 aa  120  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 85 aa  120  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 85 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  74.68 
 
 		 87 aa  120  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 84 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  63.33 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 87 aa  116  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  71.6 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  77.78 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  114  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  70.73 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 93 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 86 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  77.78 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  76.81 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>