63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1132 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  50.29 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  50.29 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  47.34 
 
 
371 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  39.55 
 
 
345 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  39.55 
 
 
345 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  37.96 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  38.7 
 
 
345 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  37.5 
 
 
341 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  37.21 
 
 
345 aa  226  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  36.54 
 
 
345 aa  225  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  36.63 
 
 
344 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  36.63 
 
 
344 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  36.63 
 
 
344 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  36.34 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  38.79 
 
 
349 aa  212  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  38.46 
 
 
349 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  40.79 
 
 
396 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  35.91 
 
 
514 aa  192  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  37.36 
 
 
523 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  35.76 
 
 
530 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  36.69 
 
 
411 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  32.91 
 
 
416 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  36.45 
 
 
424 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  34.35 
 
 
407 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  33.12 
 
 
406 aa  142  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  34.01 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  31.87 
 
 
427 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  32.26 
 
 
432 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
456 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  35.23 
 
 
364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  27.87 
 
 
420 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  31.51 
 
 
595 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  34.55 
 
 
393 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  34.31 
 
 
367 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  34.53 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  33.94 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  35.42 
 
 
361 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  30.21 
 
 
721 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  31.25 
 
 
566 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  30.82 
 
 
383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  25.11 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  29.7 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  29 
 
 
777 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  27.06 
 
 
831 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  26.74 
 
 
498 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  29.57 
 
 
746 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  30.2 
 
 
632 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  29.52 
 
 
503 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  30.41 
 
 
514 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  29.67 
 
 
520 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  26.12 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  24.48 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  25.37 
 
 
686 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  25.12 
 
 
393 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  25.23 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  28.29 
 
 
768 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  28.18 
 
 
726 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  23.33 
 
 
530 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  27.49 
 
 
800 aa  46.2  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  26.94 
 
 
675 aa  46.2  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  28.92 
 
 
698 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  23.9 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>