More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1521 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  692    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  91.23 
 
 		 342 aa  614  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  64.51 
 
 		 328 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  64.51 
 
 		 328 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  71.8 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  66.89 
 
 		 328 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  70.31 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  62.87 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  64.95 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  64.95 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  64.63 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  64.63 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  64.63 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  62.83 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  62.83 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  62.83 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  62.83 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  62.83 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  62.83 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  62.83 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  63.12 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  62.46 
 
 		 331 aa  349  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  50.81 
 
 		 344 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  50.51 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  51.03 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  50.52 
 
 		 337 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  46.1 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  48.16 
 
 		 354 aa  248  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  48.77 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  46.21 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  52.88 
 
 		 346 aa  243  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  43.3 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  44.1 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  42.73 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  40.06 
 
 		 281 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  39.76 
 
 		 281 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  41.36 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  43.53 
 
 		 339 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  41.51 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  38.36 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  37.72 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  39.35 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  42.04 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  35.8 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  35.51 
 
 		 326 aa  192  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  32.72 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  37.9 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  35.79 
 
 		 329 aa  175  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  36.3 
 
 		 335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  34.33 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  35.89 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  33.99 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  34.88 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  32.57 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  35.49 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  36.46 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  30.06 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  29.47 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  34.26 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  31.87 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.78 
 
 		 395 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  34.95 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  31.19 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  30.03 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.14 
 
 		 500 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  27.79 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 		 477 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 		 505 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  28 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  30.54 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  28.53 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 		 426 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  30.4 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  31.15 
 
 		 356 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  32 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  29.15 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  32.9 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  29.55 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  31.21 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  31.47 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  32.58 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  31.39 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  26.52 
 
 		 500 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  30.24 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  31.41 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  29.96 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  28.97 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  30.1 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  27.12 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  27.12 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  31.9 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  26.53 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  30.94 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>