More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_13851 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  34.89 
 
 
357 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  34.29 
 
 
387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  31.94 
 
 
358 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  37.97 
 
 
478 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  36.67 
 
 
492 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  30.64 
 
 
495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  34.58 
 
 
473 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  32.64 
 
 
495 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  32.64 
 
 
495 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  31.75 
 
 
551 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08781  hypothetical protein  27.08 
 
 
415 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000165811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  29.3 
 
 
580 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  24.8 
 
 
415 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  25.72 
 
 
356 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.61 
 
 
781 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  26.51 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  26.6 
 
 
897 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  38.89 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17951  hypothetical protein  25.14 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  25.25 
 
 
910 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.67 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  25.62 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  25.17 
 
 
869 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  24.92 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
508 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  28.03 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  24.93 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  32.72 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  27.14 
 
 
852 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  26.51 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  26.62 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  25.87 
 
 
803 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  27.89 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  32.72 
 
 
191 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  27.89 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  27.71 
 
 
948 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  24.91 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  35.71 
 
 
187 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  27.89 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  24.29 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  24.11 
 
 
912 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  26.44 
 
 
869 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  31.25 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  26.97 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  31.25 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  24.11 
 
 
828 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  27.65 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  24.26 
 
 
922 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  24.11 
 
 
828 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.65 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.05 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25.86 
 
 
919 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.05 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  24.3 
 
 
875 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  32.02 
 
 
577 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  23.94 
 
 
800 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.05 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  23.94 
 
 
877 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.05 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.05 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  26.73 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.45057 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  26.25 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  26.25 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 
921 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.25 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.7 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.25 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  26.03 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.25 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  26.25 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.89 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.25 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  26.25 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  25.08 
 
 
919 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  26.3 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  26.45 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  24.9 
 
 
940 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.1 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  32.54 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
196 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  31.43 
 
 
208 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  27.97 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  25.27 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  29.03 
 
 
200 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  27 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.73 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.73 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  32.12 
 
 
205 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  25.9 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.73 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.24 
 
 
877 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.73 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  25.31 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  25.74 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  21.35 
 
 
779 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  23.92 
 
 
915 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  26.15 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  25.56 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>