More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_13981 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 170 aa  340  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  64.75 
 
 		 139 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17711  50S ribosomal protein L21  65.29 
 
 		 139 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0269393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0546  50S ribosomal protein L21  68.47 
 
 		 125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.797302  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  61.34 
 
 		 121 aa  164  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  66.96 
 
 		 133 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1442  50S ribosomal protein L21  67 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15451  50S ribosomal protein L21  67 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.946865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  65 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15301  50S ribosomal protein L21  66 
 
 		 146 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1219  50S ribosomal protein L21  51.18 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  101  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  42.73 
 
 		 224 aa  95.5  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2771  50S ribosomal protein L21  53.7 
 
 		 123 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0693096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3346  50S ribosomal protein L21  53.7 
 
 		 123 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  39 
 
 		 104 aa  92.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 146 aa  91.3  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1516  50S ribosomal protein L21  41.41 
 
 		 130 aa  90.9  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00385929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 104 aa  90.5  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 114 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  38.61 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0423  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 135 aa  88.6  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  37 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 104 aa  85.5  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 105 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  38.05 
 
 		 208 aa  84.7  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  85.1  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3466  50S ribosomal protein L21  46.85 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  84.3  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  84  9e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  35 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  40 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  36.54 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  36.54 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35695  predicted protein  39 
 
 		 103 aa  80.5  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00157313  normal  0.015942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3243  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  39 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  32 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  39 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  36 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  38.18 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  36 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  34 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  33 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3033  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  34 
 
 		 103 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  34 
 
 		 103 aa  77  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  35 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  35 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  37 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  32 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  34 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  33 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  32 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  34 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  39.18 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  37 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>