48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3924 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  89.52 
 
 		 645 aa  1132    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  89.68 
 
 		 645 aa  1138    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  100 
 
 		 649 aa  1300    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  35.04 
 
 		 626 aa  327  6e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  30.88 
 
 		 603 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  29.08 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  28.68 
 
 		 630 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  26.05 
 
 		 608 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  26.78 
 
 		 651 aa  195  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  25.04 
 
 		 645 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  24.53 
 
 		 643 aa  153  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  24.14 
 
 		 648 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  23.09 
 
 		 654 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  23.06 
 
 		 655 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  22.78 
 
 		 656 aa  134  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  23.86 
 
 		 649 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  23.62 
 
 		 654 aa  124  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  20.83 
 
 		 642 aa  108  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  22.98 
 
 		 655 aa  106  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  24.78 
 
 		 634 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  23.67 
 
 		 632 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  23.67 
 
 		 632 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  25.73 
 
 		 611 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  23.49 
 
 		 610 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  23.71 
 
 		 580 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  21.64 
 
 		 646 aa  70.1  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  24.04 
 
 		 615 aa  68.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  20.71 
 
 		 709 aa  61.2  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.53 
 
 		 677 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  23.03 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  23.03 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  23.03 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  23.03 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  22.86 
 
 		 617 aa  57  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  23.31 
 
 		 617 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  22.66 
 
 		 617 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  22.66 
 
 		 617 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  20.91 
 
 		 656 aa  53.5  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  22.95 
 
 		 617 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  22.26 
 
 		 611 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  21.8 
 
 		 618 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  21.8 
 
 		 618 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  21.63 
 
 		 618 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  20.78 
 
 		 655 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  21.56 
 
 		 618 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  21.63 
 
 		 618 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  22.7 
 
 		 675 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  28.5 
 
 		 599 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>