More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3073 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  100 
 
 
508 aa  1019    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  76.38 
 
 
512 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  76.76 
 
 
513 aa  778    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  59.84 
 
 
511 aa  591  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  59.19 
 
 
509 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  51.62 
 
 
499 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  49.09 
 
 
499 aa  500  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  46.68 
 
 
513 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  44.76 
 
 
496 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  47.96 
 
 
508 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  46.17 
 
 
513 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  46.48 
 
 
513 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  47.73 
 
 
503 aa  443  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  45.11 
 
 
503 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  45.82 
 
 
505 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  45.76 
 
 
517 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  44.8 
 
 
501 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.68 
 
 
512 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.5 
 
 
501 aa  428  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
527 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  46.29 
 
 
512 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  45.92 
 
 
518 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.98 
 
 
516 aa  432  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.69 
 
 
501 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  47.22 
 
 
524 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  46.29 
 
 
512 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.98 
 
 
514 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
505 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  47.31 
 
 
507 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.11 
 
 
514 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.49 
 
 
495 aa  431  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  46.78 
 
 
517 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  46.39 
 
 
512 aa  428  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  46.41 
 
 
524 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  46.78 
 
 
517 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
501 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  44.2 
 
 
501 aa  428  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.81 
 
 
492 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  46.41 
 
 
524 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  46.78 
 
 
517 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  42.57 
 
 
501 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  44.97 
 
 
513 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  46.22 
 
 
524 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.38 
 
 
524 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 
517 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 
517 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  46.45 
 
 
498 aa  423  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.08 
 
 
514 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  46.18 
 
 
500 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.48 
 
 
495 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  44.53 
 
 
505 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  43.91 
 
 
501 aa  425  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.08 
 
 
514 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  46.8 
 
 
524 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
517 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
517 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  46.18 
 
 
517 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  42.18 
 
 
501 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  46.33 
 
 
512 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.26 
 
 
514 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  45.83 
 
 
517 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  44.85 
 
 
507 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  46.85 
 
 
521 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  43.86 
 
 
495 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  45.34 
 
 
516 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  45.67 
 
 
511 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  45.14 
 
 
518 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 
525 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.15 
 
 
497 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.81 
 
 
517 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.75 
 
 
513 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  43.56 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
521 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.38 
 
 
515 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 
515 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.29 
 
 
517 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  45.63 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.67 
 
 
513 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  45.33 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.85 
 
 
520 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  43.2 
 
 
501 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  44.44 
 
 
501 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
510 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.27 
 
 
512 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  46.36 
 
 
524 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  44.58 
 
 
861 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  44.65 
 
 
503 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  45.09 
 
 
504 aa  415  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  43.06 
 
 
503 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.65 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  45.58 
 
 
497 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0542  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 
511 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  43.65 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  45.98 
 
 
508 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.49 
 
 
499 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  43.65 
 
 
501 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.66 
 
 
507 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  45.45 
 
 
519 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  43.65 
 
 
501 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>