More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0017 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  100 
 
 		 375 aa  745    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  88.74 
 
 		 374 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  71.5 
 
 		 381 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  72.41 
 
 		 376 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  65.55 
 
 		 420 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  72.34 
 
 		 375 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  76.8 
 
 		 386 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  52.69 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  51.25 
 
 		 373 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  49.7 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  48.94 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  48.51 
 
 		 389 aa  275  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  49.07 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  49.07 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  47.68 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  47.47 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  48.66 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  44.51 
 
 		 373 aa  262  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  48.57 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  48.68 
 
 		 345 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  51.63 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  50.17 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  47.44 
 
 		 377 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  47.23 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  47.23 
 
 		 342 aa  247  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  44.98 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  43.75 
 
 		 296 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  37.35 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  40.51 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  43.22 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  43.85 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  39.19 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  39.56 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  39.56 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  37.76 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  39.61 
 
 		 289 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  35.05 
 
 		 324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  42.62 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  37.38 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  37.16 
 
 		 291 aa  150  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  32.25 
 
 		 285 aa  142  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  33.7 
 
 		 421 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  33.9 
 
 		 259 aa  141  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  30.47 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  33.98 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  34.87 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  31.78 
 
 		 426 aa  139  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  30.65 
 
 		 433 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  32.19 
 
 		 273 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.2 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  34.87 
 
 		 291 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  36.43 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.87 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  32.57 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  29.03 
 
 		 295 aa  137  4e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  29.8 
 
 		 287 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.89 
 
 		 292 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.99 
 
 		 420 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  37.07 
 
 		 464 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  30.91 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  137  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  32.02 
 
 		 292 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  29.8 
 
 		 287 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33 
 
 		 291 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  30.11 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  31.62 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  33 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  33 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  32.46 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  33 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  33 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  33.98 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  32.19 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  35.78 
 
 		 464 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  30.6 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 		 435 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  32.55 
 
 		 284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  27.81 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  33.62 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  33.07 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  32.57 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  36.08 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  30.23 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  32.95 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  37.34 
 
 		 537 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  30.07 
 
 		 455 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  31.56 
 
 		 441 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  34.62 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.45 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  31.79 
 
 		 292 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  32.56 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>