More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2804 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  100 
 
 
289 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  57.09 
 
 
288 aa  314  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  57.09 
 
 
288 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  57.09 
 
 
288 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  57.09 
 
 
288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  57.09 
 
 
288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  53.85 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  52.92 
 
 
312 aa  277  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  49.82 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  48.19 
 
 
277 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  52.27 
 
 
278 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  52.27 
 
 
278 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  52.04 
 
 
306 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  44.01 
 
 
294 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  45.15 
 
 
281 aa  241  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  47.17 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  49.61 
 
 
278 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  45.52 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  44.57 
 
 
280 aa  231  9e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  43.01 
 
 
300 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  44.49 
 
 
285 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  46.24 
 
 
274 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  44.57 
 
 
291 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  43.51 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  44.74 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  40.3 
 
 
285 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  41.26 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  48.67 
 
 
289 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  42.11 
 
 
287 aa  215  7e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  40.89 
 
 
285 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  46.39 
 
 
304 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  45.8 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  47.71 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  45.8 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  40.89 
 
 
285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  46.99 
 
 
290 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  43.68 
 
 
294 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  39.33 
 
 
297 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  39.33 
 
 
297 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  39.33 
 
 
297 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  40.45 
 
 
285 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  47.83 
 
 
289 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  41.26 
 
 
285 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  39.55 
 
 
286 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  39.55 
 
 
286 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  39.55 
 
 
286 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  39.55 
 
 
286 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  41.83 
 
 
286 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  44.36 
 
 
289 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  43.23 
 
 
281 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  39.18 
 
 
286 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  42.54 
 
 
278 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  42.54 
 
 
278 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  43.19 
 
 
286 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  39.78 
 
 
277 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  42.64 
 
 
285 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  45.93 
 
 
290 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  46.72 
 
 
303 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  42.69 
 
 
281 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  45.29 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  40.67 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  39.93 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  42.96 
 
 
299 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  40.52 
 
 
286 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  42.02 
 
 
285 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  40.81 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  42.48 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  41.48 
 
 
279 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  43.51 
 
 
286 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  39.03 
 
 
285 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  39.58 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  43.94 
 
 
297 aa  195  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  40.51 
 
 
282 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  40.51 
 
 
282 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  40.15 
 
 
286 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  40.46 
 
 
287 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  40.51 
 
 
282 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  39.3 
 
 
280 aa  193  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  40.68 
 
 
286 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  42.52 
 
 
275 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  40.15 
 
 
282 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  41.9 
 
 
287 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  39.03 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  41.6 
 
 
286 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  40.61 
 
 
287 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  41.6 
 
 
286 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  40 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  42.28 
 
 
280 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  37.96 
 
 
285 aa  188  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  40.38 
 
 
290 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  40.38 
 
 
290 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  40.7 
 
 
292 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  40.15 
 
 
294 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  40.15 
 
 
294 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  40.15 
 
 
294 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  40.38 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  42.75 
 
 
285 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  37.17 
 
 
279 aa  182  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  38.06 
 
 
276 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  40.91 
 
 
312 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>