33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_A0023 on replicon NC_007483
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  57.14 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  49.06 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  50.31 
 
 		 325 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  42.59 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  53.1 
 
 		 584 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  47.97 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  51.41 
 
 		 383 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  47.62 
 
 		 942 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  46.21 
 
 		 135 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  43.66 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  38.73 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  38.46 
 
 		 851 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  35.29 
 
 		 249 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  35.57 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  35.21 
 
 		 183 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  35.07 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  28.57 
 
 		 585 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  33.8 
 
 		 552 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  32.39 
 
 		 552 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  26.81 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  31.58 
 
 		 195 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  24.68 
 
 		 1266 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  31.63 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  29.93 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  28.67 
 
 		 598 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  29.41 
 
 		 1048 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  26.43 
 
 		 1016 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  26.43 
 
 		 1016 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  31 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  32.65 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  31 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.21 
 
 		 1348 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>