37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1898 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  63.57 
 
 		 568 aa  708    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  56.15 
 
 		 595 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1189    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  55.75 
 
 		 602 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  49.6 
 
 		 624 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  54.35 
 
 		 580 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  34.29 
 
 		 602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1293  hypothetical protein  70.69 
 
 		 183 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.833643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  31.42 
 
 		 551 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  31.31 
 
 		 580 aa  223  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  29.75 
 
 		 631 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  29.69 
 
 		 605 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  29.59 
 
 		 631 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  28.33 
 
 		 634 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  27.91 
 
 		 634 aa  180  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  28.07 
 
 		 624 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  26.29 
 
 		 585 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  27.52 
 
 		 624 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  27.14 
 
 		 935 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  27.6 
 
 		 624 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  33.96 
 
 		 715 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  30.86 
 
 		 622 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  46.08 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  42.59 
 
 		 505 aa  80.1  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  42.99 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  44.55 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  39.81 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  40.19 
 
 		 506 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  44.55 
 
 		 483 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  41.35 
 
 		 477 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  40 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  37.5 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  36 
 
 		 628 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  20.98 
 
 		 676 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0007  hypothetical protein  63.89 
 
 		 90 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  24.53 
 
 		 678 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  30.08 
 
 		 386 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>