More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1246 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  100 
 
 
214 aa  430  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  46.6 
 
 
234 aa  191  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  44.17 
 
 
209 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  44.17 
 
 
209 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  44.17 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  44.5 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  45.59 
 
 
226 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  42.58 
 
 
225 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  42.44 
 
 
259 aa  175  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  42.04 
 
 
229 aa  167  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  41.71 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  37.04 
 
 
262 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  41.67 
 
 
209 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  39.19 
 
 
234 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  40.09 
 
 
234 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  39.5 
 
 
224 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  39.19 
 
 
235 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  38.32 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  43.08 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  39.9 
 
 
211 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  42.56 
 
 
229 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  35.51 
 
 
215 aa  138  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  43.43 
 
 
225 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  42.31 
 
 
196 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  34.13 
 
 
219 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  39.69 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  37.76 
 
 
199 aa  128  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  38.32 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  36.5 
 
 
199 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  38.12 
 
 
199 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  38.78 
 
 
199 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  40.91 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  38.58 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  36.36 
 
 
825 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  47.54 
 
 
305 aa  102  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  35.47 
 
 
201 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  34.11 
 
 
832 aa  101  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  33.03 
 
 
208 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  34.15 
 
 
184 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  33.64 
 
 
819 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  33.02 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  34.69 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  30.52 
 
 
202 aa  92  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  35.15 
 
 
200 aa  92  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  32.6 
 
 
239 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  30.53 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  31.34 
 
 
827 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  31.77 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  32.17 
 
 
240 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 
202 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  30.95 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  28.19 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  29.65 
 
 
240 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0660  cytochrome c oxidase subunit III  30.63 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.833794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  28.71 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  29 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  27.27 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  28.42 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0257  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.77 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  31.84 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4602  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.82 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.397621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  32.86 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  31.84 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  30.52 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  30.52 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0770  quinol oxidase, subunit III  32.82 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0667  quinol oxidase subunit III  32.82 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0611  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  32.82 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0612  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  32.82 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0828  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.82 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.517619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0735  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  32.82 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0701  quinol oxidase subunit III  32.82 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  31.84 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  34.46 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  32.49 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  28.1 
 
 
208 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  37.1 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  35.42 
 
 
293 aa  81.3  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0196  ubiquinol oxidase, subunit III  30.05 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  26.07 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0589  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  31.43 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369089  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  31.79 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.57 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.48 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0991  ubiquinol oxidase, subunit III  30.52 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.532758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  28.51 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.7 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.57 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  26.5 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  34.72 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  29.13 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  31.71 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  30.19 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0481  cytochrome c oxidase subunit III  31.34 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  29.95 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>