77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1067 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  61.11 
 
 
406 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  57.64 
 
 
405 aa  173  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  57.64 
 
 
415 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  57.53 
 
 
409 aa  168  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  55.94 
 
 
408 aa  167  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  59.31 
 
 
409 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  56.25 
 
 
402 aa  165  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  57.93 
 
 
406 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  56.55 
 
 
406 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  57.24 
 
 
407 aa  159  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  57.24 
 
 
406 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  56.25 
 
 
413 aa  158  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  54.17 
 
 
251 aa  157  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  53.47 
 
 
412 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  54.48 
 
 
405 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  57.64 
 
 
405 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  54.86 
 
 
257 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  53.47 
 
 
257 aa  147  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  53.1 
 
 
423 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  49.66 
 
 
410 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  55.86 
 
 
407 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  48.63 
 
 
258 aa  143  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  48.99 
 
 
410 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  47.62 
 
 
255 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  51.39 
 
 
410 aa  137  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  49.66 
 
 
397 aa  133  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  46.53 
 
 
256 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  45.14 
 
 
256 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  48.94 
 
 
259 aa  121  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  51.39 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  51.39 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  42.36 
 
 
250 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  46.9 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  39.46 
 
 
250 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  37.41 
 
 
259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  37.76 
 
 
259 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  40.28 
 
 
256 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  40.71 
 
 
411 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.67 
 
 
261 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  37.97 
 
 
248 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  38.75 
 
 
259 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  31.58 
 
 
274 aa  50.4  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  27.72 
 
 
260 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30.83 
 
 
246 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  33.67 
 
 
258 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  29.37 
 
 
253 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  36.47 
 
 
274 aa  44.3  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 
290 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  38.57 
 
 
374 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  35.29 
 
 
263 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  30.49 
 
 
252 aa  43.5  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  35.29 
 
 
647 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  35.06 
 
 
474 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  36.23 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  28.41 
 
 
255 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.73 
 
 
276 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  31.68 
 
 
311 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  33.85 
 
 
320 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  32.29 
 
 
473 aa  41.2  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  24.48 
 
 
253 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  34.74 
 
 
272 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 
253 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 
270 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  36.23 
 
 
634 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  35.71 
 
 
276 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  35.94 
 
 
1533 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  35.71 
 
 
276 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  35.94 
 
 
658 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  35.94 
 
 
658 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  35.94 
 
 
636 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  35.94 
 
 
658 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
273 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  35.14 
 
 
259 aa  40.4  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  34.78 
 
 
442 aa  40  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
256 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>