More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2754 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
151 aa  309  7e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  71.22 
 
 
172 aa  207  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  66.43 
 
 
145 aa  196  1e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  62.76 
 
 
162 aa  195  2e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  65.71 
 
 
145 aa  194  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 
152 aa  192  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  64.29 
 
 
154 aa  189  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  62.07 
 
 
162 aa  186  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
150 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
150 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
150 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
207 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
150 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
150 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  63.83 
 
 
147 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  1.05156e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
150 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
207 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
150 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 
150 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  62.86 
 
 
151 aa  184  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 
207 aa  184  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 
150 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.60325e-05 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 
150 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 
150 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  61.7 
 
 
149 aa  183  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  62.86 
 
 
151 aa  183  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 
148 aa  183  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 
156 aa  182  1e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  63.5 
 
 
141 aa  182  2e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.39911e-15  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  60.28 
 
 
149 aa  179  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 
150 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.87 
 
 
150 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  63.04 
 
 
151 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  63.04 
 
 
151 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 
155 aa  176  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 
155 aa  176  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  62.59 
 
 
147 aa  176  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  62.59 
 
 
147 aa  176  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  61.59 
 
 
150 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  63.04 
 
 
151 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 
148 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 
151 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 
150 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
146 aa  174  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.57 
 
 
146 aa  174  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 
150 aa  172  2e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 
149 aa  171  2e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 
145 aa  171  3e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 
147 aa  170  6e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 
147 aa  170  6e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 
147 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 
148 aa  167  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.57 
 
 
149 aa  166  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.93 
 
 
150 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.03 
 
 
148 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 
178 aa  165  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 
178 aa  165  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 
167 aa  164  3e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.17323e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  62.22 
 
 
150 aa  164  3e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 
150 aa  164  3e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 
153 aa  164  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0197  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 
153 aa  164  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 
150 aa  163  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.74 
 
 
145 aa  163  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 
161 aa  162  2e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 
148 aa  162  2e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  59.26 
 
 
146 aa  162  2e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  58.96 
 
 
150 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  57.86 
 
 
149 aa  160  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 
146 aa  159  8e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 
151 aa  159  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 
179 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 
166 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  55.4 
 
 
153 aa  158  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 
145 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  56.72 
 
 
144 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.27848e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  56.3 
 
 
153 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 
149 aa  157  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1369  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.3 
 
 
159 aa  156  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 
145 aa  156  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 
151 aa  156  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.78 
 
 
152 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 
149 aa  156  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03831  3-dehydroquinate dehydratase  58.06 
 
 
148 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 
144 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 
147 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.95076e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.43 
 
 
184 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 
143 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
148 aa  154  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  2.93709e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 
159 aa  154  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.74 
 
 
144 aa  153  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 
144 aa  153  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 
148 aa  153  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 
144 aa  153  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 
153 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 
142 aa  153  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 
153 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 
146 aa  153  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
148 aa  153  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  7.97805e-05 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0040  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 
244 aa  152  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>