45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0123 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0123  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  68.18 
 
 		 193 aa  97.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  71.21 
 
 		 188 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  71.21 
 
 		 188 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  59.09 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  45.45 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  45.45 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  43.94 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  43.08 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  40.91 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  41.67 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  40.91 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  43.64 
 
 		 302 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0945  phage integrase family protein  40.82 
 
 		 211 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.237394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0563  phage integrase family protein  40.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00000738062  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  39.66 
 
 		 299 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  38.98 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.13 
 
 		 322 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  44.44 
 
 		 307 aa  42.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  32.35 
 
 		 400 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  32.35 
 
 		 400 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  31.34 
 
 		 400 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.43 
 
 		 324 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.43 
 
 		 321 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.43 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.43 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  31.34 
 
 		 467 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2107  integrase family protein  36.54 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.26894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4273  integrase family protein  36.54 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42005  normal  0.068032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 		 331 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  42.11 
 
 		 344 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  40 
 
 		 315 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  38.18 
 
 		 228 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.43 
 
 		 351 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  30.77 
 
 		 313 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.18 
 
 		 323 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0838  integrase  36 
 
 		 432 aa  40.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  40.38 
 
 		 443 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  36.73 
 
 		 328 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  41.18 
 
 		 313 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.76 
 
 		 315 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  37.5 
 
 		 292 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.51 
 
 		 315 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>