56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0205 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  100 
 
 		 118 aa  240  3.9999999999999997e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 		 412 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  31.9 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  32.74 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  33.61 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  34.62 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  29.27 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  29.27 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 363 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  31.36 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.51 
 
 		 378 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.31 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  32.08 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  30.51 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  29.75 
 
 		 383 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  32.14 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  30.51 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  30.51 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.06 
 
 		 378 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  31.9 
 
 		 322 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  35.78 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  27.19 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  31.67 
 
 		 452 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  29.66 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  32.89 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  33.33 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  27.19 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.25 
 
 		 364 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.57 
 
 		 356 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.51 
 
 		 427 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  28.57 
 
 		 313 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.41 
 
 		 369 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 378 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.57 
 
 		 365 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.57 
 
 		 365 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.57 
 
 		 365 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1375  RNase HI  29.82 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.65904  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  27.83 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  37.04 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  28.07 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  27.12 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  36.84 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  40.79 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1135  ribonuclease H  31.03 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  32.48 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  35.85 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0660  Ribonuclease H  32.26 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.489941  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  32.89 
 
 		 157 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  26.67 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  26.96 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  33.33 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  33.33 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  25.44 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 411 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>