74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1375 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1375  RNase HI  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.65904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0926  RNase HI  40.94 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  37.5 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  37.01 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  37.01 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  37.01 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  37.01 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  37.01 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  37.01 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  37.01 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  34.65 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  30.95 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  29.37 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  29.37 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  30.77 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  38.27 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  32.14 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  31.3 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  32.14 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  32.14 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  28.47 
 
 		 241 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  34.94 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  27.27 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  31.33 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1098  hypothetical protein  31.63 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  30.95 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  35.71 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  28.92 
 
 		 236 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  32.94 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  29.76 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0761  ribonuclease H  34.67 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  32.14 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  35.06 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  33.33 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  35.06 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  28.06 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  32.18 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  35.06 
 
 		 151 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  28.24 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  30.95 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  33.77 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  34.67 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  32.53 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  27.21 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  30.12 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  30.67 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  26.47 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  29.87 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  28.57 
 
 		 156 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  31.82 
 
 		 145 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  32 
 
 		 153 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  27.71 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  31.65 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  26.47 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  32 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  27.38 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  32 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  29.49 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1324  hypothetical protein  28.15 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000515383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  32 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3682  hypothetical protein  27.21 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  30.67 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1694  hypothetical protein  25.74 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1482  hypothetical protein  25.74 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00299732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  25.74 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  25.74 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  26.92 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  34.67 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  34.67 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2941  ribonuclease H  29.76 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2077  ribonuclease H  50 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498746  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  34.67 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>