35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0926 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0926  RNase HI  100 
 
 		 131 aa  270  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1375  RNase HI  40.94 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.65904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  35.66 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  35.66 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  36.57 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  34.33 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  34.33 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  34.33 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  34.33 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  34.33 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  34.33 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  34.33 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  34.33 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  35.61 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  31.82 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  31.82 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  33.64 
 
 		 157 aa  50.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  30.34 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  32.58 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  32.58 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  29.25 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  28.26 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  29.13 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  26.28 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  25.81 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  33.77 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  23.26 
 
 		 370 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 		 440 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  24.24 
 
 		 369 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  28.71 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  28.71 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  28.71 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  27.78 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  22.9 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 401 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>